More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0712 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0712  PHP domain protein  100 
 
 
290 aa  595  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0717  PHP domain protein  54.48 
 
 
291 aa  295  6e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0221894  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1744  PHP domain protein  47.18 
 
 
286 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1922  PHP domain protein  44.93 
 
 
279 aa  229  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177162  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2305  phosphotransferase domain-containing protein  43.46 
 
 
288 aa  227  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2646  PHP domain protein  47.06 
 
 
294 aa  219  6e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3094  phosphoesterase PHP-like  44.17 
 
 
289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0818  PHP domain protein  41.43 
 
 
285 aa  209  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2747  PHP-like protein  39.07 
 
 
282 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000315377  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1639  phosphotransferase domain-containing protein  40.86 
 
 
275 aa  204  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0722  phosphotransferase domain-containing protein  40.53 
 
 
280 aa  200  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22340  PHP domain protein  38.64 
 
 
281 aa  192  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3436  phosphotransferase domain-containing protein  39.86 
 
 
287 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3606  PHP domain protein  35.55 
 
 
279 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1562  PHP domain protein  42.23 
 
 
287 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3099  PHP domain protein  38.61 
 
 
286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000891191  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1503  phosphotransferase domain-containing protein  37.23 
 
 
294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0032645  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0662  phosphotransferase domain-containing protein  38.67 
 
 
267 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1914  phosphotransferase domain-containing protein  35.11 
 
 
275 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.629211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1085  PHP-like  41.06 
 
 
280 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000274963  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1326  PHP domain protein  38.73 
 
 
286 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00676626  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11830  PHP domain protein  33.45 
 
 
270 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1622  phosphotransferase domain-containing protein  35.29 
 
 
278 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0489037  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2314  PHP-like  37.84 
 
 
279 aa  169  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1931  PHP domain protein  37.98 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3096  PHP domain protein  35.34 
 
 
275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.81297  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2808  phosphotransferase domain-containing protein  37.27 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000695757  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2618  phosphotransferase domain-containing protein  38.13 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1975  PHP-like  37.23 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000544393  normal  0.0436962 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2251  PHP domain protein  34.4 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.825482  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1266  PHP domain protein  39.2 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4086  PHP domain protein  36.03 
 
 
264 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0664  phosphotransferase domain-containing protein  33.46 
 
 
286 aa  163  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1448  phosphotransferase domain-containing protein  36.17 
 
 
288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.216828  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1367  PHP domain protein  38.8 
 
 
283 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1693  PHP domain protein  35.37 
 
 
286 aa  162  7e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1870  PHP domain protein  34.15 
 
 
286 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0116618 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1064  phosphotransferase domain-containing protein  36.36 
 
 
270 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000146557  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2582  phosphoesterase, PHP-like  38.4 
 
 
283 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1270  hypothetical protein  35.57 
 
 
280 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1092  metal-dependent phosphoesterase  35.57 
 
 
314 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201049  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1912  PHP domain protein  36.92 
 
 
293 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.657116 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1248  PHP family metal-dependent phosphoesterase  35.46 
 
 
284 aa  159  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1471  PHP domain protein  38.19 
 
 
273 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0481  phosphoesterase PHP-like  33.09 
 
 
286 aa  156  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.245834  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2311  PHP domain protein  36.14 
 
 
285 aa  156  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000176637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1278  phosphotransferase domain-containing protein  36.29 
 
 
279 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1536  PHP domain protein  35.8 
 
 
274 aa  155  9e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1397  hypothetical protein  33.46 
 
 
279 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1599  hypothetical protein  32.82 
 
 
279 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1553  phosphoesterase PHP-like  39.76 
 
 
297 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.653581  normal  0.211268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7822  PHP domain protein  36.15 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1736  PHP domain protein  33.82 
 
 
286 aa  152  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0909  metal-dependent phosphoesterase  34.74 
 
 
291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.531457  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0443  phosphoesterase PHP-like  32.8 
 
 
286 aa  152  8e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.798284  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  35.93 
 
 
278 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1941  PHP domain protein  39.35 
 
 
289 aa  149  4e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0735  phosphotransferase domain-containing protein  38.28 
 
 
284 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884274  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0662  phosphotransferase domain-containing protein  33.81 
 
 
294 aa  149  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0883  TrpH protein  32.59 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.33957  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1877  PHP-like protein  35.36 
 
 
284 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1492  PHP C-terminal domain protein  29.54 
 
 
287 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1356  phosphotransferase domain-containing protein  29.54 
 
 
287 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1610  phosphotransferase domain-containing protein  29.89 
 
 
287 aa  142  6e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4500  trpH family protein  37.07 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655584  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1412  phosphotransferase domain-containing protein  36.68 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0394495  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4006  phosphotransferase domain-containing protein  36.58 
 
 
286 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000044787 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15640  Phosphoesterase (PHP family)  37.4 
 
 
287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.3789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3586  phosphoesterase PHP, N-terminal:PHP, C-terminal  34.63 
 
 
287 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1465  phosphotransferase domain-containing protein  36.12 
 
 
296 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1078  PHP domain protein  35.16 
 
 
286 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0351695  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2309  PHP domain protein  35.32 
 
 
290 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1926  hypothetical protein  35.43 
 
 
295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7842  phosphotransferase domain-containing protein  38.28 
 
 
284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3789  phosphotransferase domain-containing protein  36.19 
 
 
286 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000806386 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1155  hypothetical protein  35.74 
 
 
281 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2666  phosphotransferase domain-containing protein  33.95 
 
 
295 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000470189 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0261  phosphotransferase domain-containing protein  35.71 
 
 
270 aa  136  5e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0982  PHP domain protein  35.16 
 
 
286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.727883  normal  0.091006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1796  phosphotransferase domain-containing protein  37.69 
 
 
284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.757775  normal  0.756864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0511  phosphoesterase PHP, N-terminal  36.86 
 
 
290 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.369716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1810  PHP domain protein  34.24 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1487  PHP-like  35.43 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2203  phosphotransferase domain-containing protein  33.46 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209881 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2402  phosphotransferase domain-containing protein  34.41 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3835  PHP domain protein  34.48 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22820  PHP domain-containing protein  37.11 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.141448 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2164  PHP domain protein  37.98 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  hitchhiker  0.000429759 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0150  phosphotransferase domain-containing protein  34.82 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2250  phosphotransferase domain-containing protein  34.54 
 
 
286 aa  133  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1163  PHP domain protein  34.77 
 
 
285 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.445299  normal  0.321925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1140  hypothetical protein  34.38 
 
 
286 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1101  PHP domain protein  31.64 
 
 
286 aa  132  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0987  hypothetical protein  31.64 
 
 
286 aa  132  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.561558  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0681  phosphotransferase domain-containing protein  37.89 
 
 
284 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255155  normal  0.888291 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0359  phosphotransferase domain-containing protein  37.35 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.663247  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1644  phosphotransferase domain-containing protein  33.06 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19240  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  36.29 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0196602  hitchhiker  0.0091278 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1432  phosphotransferase domain-containing protein  32.31 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1220  PHP domain protein  36.4 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.401834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>