More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2646 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2646  PHP domain protein  100 
 
 
294 aa  588  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2305  phosphotransferase domain-containing protein  67.35 
 
 
288 aa  359  3e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3094  phosphoesterase PHP-like  56.66 
 
 
289 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1744  PHP domain protein  53.42 
 
 
286 aa  297  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0717  PHP domain protein  48.95 
 
 
291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0221894  normal  0.740121 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0818  PHP domain protein  46.1 
 
 
285 aa  240  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0712  PHP domain protein  47.06 
 
 
290 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2747  PHP-like protein  44.13 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000315377  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1922  PHP domain protein  40 
 
 
279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3099  PHP domain protein  40.5 
 
 
286 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000891191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1622  phosphotransferase domain-containing protein  37.8 
 
 
278 aa  182  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0489037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11830  PHP domain protein  35.82 
 
 
270 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22340  PHP domain protein  39.43 
 
 
281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2618  phosphotransferase domain-containing protein  37.2 
 
 
291 aa  178  8e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3436  phosphotransferase domain-containing protein  35.86 
 
 
287 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3606  PHP domain protein  35.71 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1639  phosphotransferase domain-containing protein  34.73 
 
 
275 aa  172  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1503  phosphotransferase domain-containing protein  37.19 
 
 
294 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0032645  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0722  phosphotransferase domain-containing protein  34.46 
 
 
280 aa  170  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1914  phosphotransferase domain-containing protein  38.37 
 
 
275 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.629211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3096  PHP domain protein  37.94 
 
 
275 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.81297  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1562  PHP domain protein  36.21 
 
 
287 aa  165  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1085  PHP-like  39.68 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000274963  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4086  PHP domain protein  35.66 
 
 
264 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1248  PHP family metal-dependent phosphoesterase  33.83 
 
 
284 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1536  PHP domain protein  38.4 
 
 
274 aa  157  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1064  phosphotransferase domain-containing protein  38.46 
 
 
270 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000146557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1326  PHP domain protein  37.02 
 
 
286 aa  152  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00676626  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2808  phosphotransferase domain-containing protein  36.93 
 
 
288 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000695757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0909  metal-dependent phosphoesterase  37.98 
 
 
291 aa  149  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.531457  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1553  phosphoesterase PHP-like  36.79 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.653581  normal  0.211268 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1356  phosphotransferase domain-containing protein  34.48 
 
 
287 aa  146  5e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1912  PHP domain protein  35.35 
 
 
293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.657116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7822  PHP domain protein  37.97 
 
 
288 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1931  PHP domain protein  39 
 
 
279 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.147176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1220  PHP domain protein  39.69 
 
 
280 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.401834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1278  phosphotransferase domain-containing protein  35.56 
 
 
279 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2251  PHP domain protein  34.92 
 
 
286 aa  143  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.825482  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1492  PHP C-terminal domain protein  34.1 
 
 
287 aa  143  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1644  phosphotransferase domain-containing protein  31.91 
 
 
292 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2250  phosphotransferase domain-containing protein  33.58 
 
 
286 aa  142  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1270  hypothetical protein  34.38 
 
 
280 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2311  PHP domain protein  34.72 
 
 
285 aa  142  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000176637  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1693  PHP domain protein  35.71 
 
 
286 aa  142  9e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1610  phosphotransferase domain-containing protein  34.1 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1092  metal-dependent phosphoesterase  33.73 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201049  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1796  phosphotransferase domain-containing protein  40.6 
 
 
284 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.757775  normal  0.756864 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1471  PHP domain protein  38.31 
 
 
273 aa  139  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0662  phosphotransferase domain-containing protein  31.68 
 
 
267 aa  139  6e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0443  phosphoesterase PHP-like  34.52 
 
 
286 aa  139  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.798284  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1975  PHP-like  35.42 
 
 
293 aa  138  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000544393  normal  0.0436962 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1448  phosphotransferase domain-containing protein  35.49 
 
 
288 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.216828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7842  phosphotransferase domain-containing protein  40.46 
 
 
284 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1266  PHP domain protein  34.28 
 
 
283 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3835  PHP domain protein  36.5 
 
 
291 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1870  PHP domain protein  33.73 
 
 
286 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0116618 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1580  hypothetical protein  34.96 
 
 
276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2828  PHP-like  30.97 
 
 
288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0662  phosphotransferase domain-containing protein  35.17 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1397  hypothetical protein  29.62 
 
 
279 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1599  hypothetical protein  29.27 
 
 
279 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1367  PHP domain protein  33.92 
 
 
283 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0664  phosphotransferase domain-containing protein  33.73 
 
 
286 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1985  phosphotransferase domain-containing protein  34.97 
 
 
309 aa  136  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000791669 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0481  phosphoesterase PHP-like  34.13 
 
 
286 aa  136  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.245834  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2582  phosphoesterase, PHP-like  33.57 
 
 
283 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320508  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2553  PHP domain protein  34.59 
 
 
276 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000196897  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0735  phosphotransferase domain-containing protein  39.03 
 
 
284 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884274  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2314  PHP-like  33.08 
 
 
279 aa  135  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3521  phosphotransferase domain-containing protein  30.92 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1697  PHP family metal-dependent phosphoesterase  34.88 
 
 
293 aa  132  6e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1479  PHP domain protein  31.1 
 
 
276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00132701  normal  0.722152 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1973  PHP-like  34.52 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425716  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2911  phosphotransferase domain-containing protein  32.3 
 
 
287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.367074 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1432  phosphotransferase domain-containing protein  33.97 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02287  PHP domain protein  34.12 
 
 
297 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.624872  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1687  phosphotransferase domain-containing protein  31.64 
 
 
285 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02756  hypothetical protein  31.2 
 
 
292 aa  129  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  34.33 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1941  PHP domain protein  35.81 
 
 
289 aa  127  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1163  PHP domain protein  36.19 
 
 
285 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.445299  normal  0.321925 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0883  TrpH protein  31.2 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.33957  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0511  phosphoesterase PHP, N-terminal  39.15 
 
 
290 aa  126  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.369716  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1430  phosphotransferase domain-containing protein  32.41 
 
 
286 aa  125  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2402  phosphotransferase domain-containing protein  32.02 
 
 
286 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5977  PHP-like  34.21 
 
 
279 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0687  phosphotransferase domain-containing protein  34.34 
 
 
284 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134262  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1736  PHP domain protein  33.73 
 
 
286 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2100  phosphotransferase domain-containing protein  34.21 
 
 
279 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1465  phosphotransferase domain-containing protein  37.12 
 
 
296 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0798  hypothetical protein  31.2 
 
 
290 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0987  hypothetical protein  33.46 
 
 
286 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.561558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1101  PHP domain protein  33.46 
 
 
286 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2449  PHP-like protein  31.62 
 
 
286 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1174  phosphotransferase domain-containing protein  34.6 
 
 
279 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806701  decreased coverage  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2118  phosphotransferase domain-containing protein  34.21 
 
 
279 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317755 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1867  putative phosphoesterase  34.96 
 
 
293 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000652478 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5406  PHP-like metal-dependent phosphoesterase  33.46 
 
 
279 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272926  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11310  predicted metal-dependent phosphoesterase, PHP family  35.77 
 
 
294 aa  123  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0363713  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1490  putative phosphoesterase  34.59 
 
 
286 aa  124  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>