32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0218 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0218  NERD domain protein  100 
 
 		 310 aa  642    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3205  NERD domain protein  40.58 
 
 		 304 aa  247  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.474591  normal  0.680793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1003  NERD domain-containing protein  44.63 
 
 		 344 aa  208  9e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0665  HRDC domain-containing protein  29.96 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.126203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0664  HRDC domain-containing protein  29.15 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0121317  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3961  NERD domain-containing protein  31.95 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0609224  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3845  NERD domain-containing protein  32.74 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3374  NERD domain-containing protein  31.1 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000216973  decreased coverage  0.000336538 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0647  NERD domain-containing protein  31.1 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016807  hitchhiker  0.00000125306 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0648  NERD domain-containing protein  31.1 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188576  normal  0.0135957 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0675  NERD domain-containing protein  31.71 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.160777  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0336  hypothetical protein  28.57 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3657  NERD domain-containing protein  32 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.779126  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5325  hypothetical protein  27.22 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4947  hypothetical protein  27.22 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5226  nerd domain protein  27.78 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0869154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4808  hypothetical protein  27.27 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0019  nerd domain protein  27.27 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.580862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5222  hypothetical protein  26.55 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3660  NERD domain-containing protein  24.36 
 
 		 323 aa  52.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5243  nerd domain protein  27.27 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0503  NERD domain-containing protein  22.97 
 
 		 224 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.180514  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4790  hypothetical protein  26.7 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3685  NERD domain-containing protein  29.79 
 
 		 353 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0313  DNA topoisomerase I  25.48 
 
 		 260 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5192  nerd domain protein  26.26 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3691  NERD domain-containing protein  28.03 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.003996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3085  NERD domain protein  27.78 
 
 		 478 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  32.5 
 
 		 212 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  32.5 
 
 		 212 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3613  NERD domain protein  28.57 
 
 		 228 aa  42.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646238  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1416  NERD domain-containing protein  20.28 
 
 		 225 aa  42.4  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>