15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1132 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1132  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  370  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4922  protein of unknown function UPF0153  38.04 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4265  hypothetical protein  33.64 
 
 
194 aa  48.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2118  protein of unknown function UPF0153  35.71 
 
 
235 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0058  hypothetical protein  25.89 
 
 
276 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0691845  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0276  protein of unknown function UPF0153  28.24 
 
 
233 aa  45.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000967399  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1059  protein of unknown function UPF0153  28.32 
 
 
214 aa  45.1  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1987  hypothetical protein  25.41 
 
 
224 aa  44.7  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1638  hypothetical protein  31.25 
 
 
232 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2119  hypothetical protein  28.17 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427138  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1435  hypothetical protein  33.02 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0261108  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0273  Fe-S-cluster oxidoreductase  29.32 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0114  hypothetical protein  29.1 
 
 
222 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.698952  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2811  protein of unknown function UPF0153  33.08 
 
 
169 aa  41.2  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284403  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1299  hypothetical protein  30.1 
 
 
236 aa  40.8  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>