28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5059 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5059  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 101 aa  210  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2492  putative transcriptional regulator  93.07 
 
 		 101 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298845  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3145  putative transcriptional regulator  93.07 
 
 		 101 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1388  putative transcriptional regulator  93.68 
 
 		 111 aa  186  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.682529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2054  putative transcriptional regulator  82.18 
 
 		 105 aa  180  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.295818  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3120  putative transcriptional regulator  77 
 
 		 107 aa  164  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0075021  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1715  transcriptional regulator protein-like protein  75.25 
 
 		 154 aa  164  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118442  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1972  putative transcriptional regulator  75.25 
 
 		 103 aa  158  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000001755  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1528  putative transcriptional regulator  73 
 
 		 107 aa  147  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1054  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2404  HxlR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.598252  normal  0.595258 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0961  putative transcriptional regulator  38.3 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3596  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0219854  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1763  helix-turn-helix, HxlR type  33.68 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.168632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1315  HxlR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7489  transcriptional regulator, HxlR family  36.25 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6227  transcriptional regulator, HxlR family  35.87 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5094  HxlR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.709504  normal  0.631599 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1635  transcriptional regulator, HxlR family  26.73 
 
 		 119 aa  47.4  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1661  HxlR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2190  putative transcriptional regulator  28 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000426745  normal  0.636756 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2241  HxlR family transcriptional regulator  29 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1290  transcriptional regulator, HxlR family  36.14 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1415  HxlR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0193281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4594  transcriptional regulator, HxlR family  30.43 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1273  HxlR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.866565  hitchhiker  0.0000000994853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4680  transcriptional regulator, HxlR family  25.96 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1483  HxlR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>