20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4633 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4633  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 134 aa  258  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.765233  hitchhiker  0.000000449148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.48 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.019614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1480  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.96 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.934887  normal  0.224655 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.75 
 
 		 450 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.892104 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2341  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.11 
 
 		 439 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.19 
 
 		 429 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.21 
 
 		 417 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306348  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1264  hypothetical protein  31.19 
 
 		 432 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.21 
 
 		 417 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.682348 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1265  hypothetical protein  28.7 
 
 		 432 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.98 
 
 		 435 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5452  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.76 
 
 		 440 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4817  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.76 
 
 		 440 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.896318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.76 
 
 		 440 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3852  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 430 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332822  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.55 
 
 		 430 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 		 424 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0560564  normal  0.509097 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3711  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.15 
 
 		 429 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal  0.892725 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1880  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 		 431 aa  41.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>