30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4144 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3379  hypothetical protein  78.88 
 
 		 554 aa  823    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60985  normal  0.431334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4144  hypothetical protein  100 
 
 		 530 aa  1072    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462291  hitchhiker  0.000193551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1229  hypothetical protein  81.27 
 
 		 550 aa  848    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445379 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2292  hypothetical protein  75.04 
 
 		 559 aa  781    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0363731  hitchhiker  0.000163049 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0997  hypothetical protein  66.12 
 
 		 552 aa  662    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0638  hypothetical protein  64.46 
 
 		 559 aa  637    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1451  hypothetical protein  82.76 
 
 		 551 aa  875    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1317  hypothetical protein  74.51 
 
 		 559 aa  775    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195654  normal  0.119576 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2815  hypothetical protein  60.99 
 
 		 573 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0565  hypothetical protein  57.95 
 
 		 541 aa  578  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1664  hypothetical protein  54.13 
 
 		 574 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0478  hypothetical protein  52.9 
 
 		 574 aa  525  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2334  hypothetical protein  80.07 
 
 		 552 aa  499  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1527  hypothetical protein  45.78 
 
 		 586 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4454  hypothetical protein  44.37 
 
 		 575 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59070  hypothetical protein  43.49 
 
 		 579 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000160429  normal  0.0321205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2995  hypothetical protein  43.56 
 
 		 528 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2915  hypothetical protein  40.23 
 
 		 512 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3287  hypothetical protein  38.57 
 
 		 499 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0303  hypothetical protein  35.39 
 
 		 578 aa  262  8.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000587297 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3746  hypothetical protein  35.52 
 
 		 548 aa  257  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4114  hypothetical protein  35.01 
 
 		 581 aa  253  8.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0608  hypothetical protein  35.02 
 
 		 574 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1721  hypothetical protein  31.17 
 
 		 568 aa  251  3e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1348  hypothetical protein  31.17 
 
 		 568 aa  249  6e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0642  hypothetical protein  37.62 
 
 		 331 aa  192  9e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0619  hypothetical protein  37.83 
 
 		 510 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2677  hypothetical protein  30.54 
 
 		 569 aa  107  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.02 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  27.48 
 
 		 292 aa  43.5  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>