15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2097 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2097  zonular occludens toxin  100 
 
 
341 aa  700    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0561141 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0719  zonular occludens toxin  64.29 
 
 
400 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1395  Zonular occludens toxin  33.54 
 
 
351 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00397703  normal  0.781405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2548  Zonular occludens toxin  33.55 
 
 
376 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1399  Zonular occludens toxin  31.76 
 
 
382 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0437506  normal  0.88408 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3909  toxin  37.35 
 
 
308 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3268  hypothetical protein  42.08 
 
 
354 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2112  zonular occludens toxin  28.12 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.37253  normal  0.0869941 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00558  hypothetical protein  28.25 
 
 
394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.65599  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0971  zonular occludens toxin  30.51 
 
 
384 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508291  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0985  zonular occludens toxin  30.51 
 
 
384 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.51619  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0844  Zonular occludens toxin  26.53 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4473  Zonular occludens toxin  29.75 
 
 
448 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.272014  hitchhiker  0.0000467157 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0511  zona occludens toxin  23.64 
 
 
399 aa  42.7  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1061  zona occludens toxin  23.64 
 
 
399 aa  42.7  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>