19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2056 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2056  putative secreted protein  100 
 
 		 219 aa  433  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6058  putative secreted protein  43.02 
 
 		 268 aa  128  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0171  putative secreted protein  44.2 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0836284  hitchhiker  0.00335294 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6321  putative secreted protein  41.53 
 
 		 259 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6498  putative secreted protein  39.89 
 
 		 259 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6733  putative secreted protein  39.89 
 
 		 259 aa  104  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591517  normal  0.863761 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6057  hypothetical protein  35.47 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03964  hypothetical protein  40.23 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3000  hypothetical protein  34.29 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6732  hypothetical protein  35.12 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.921857  normal  0.835768 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6497  hypothetical protein  35.12 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6320  hypothetical protein  33.93 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463448  normal  0.556434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4909  hypothetical protein  32 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4908  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03963  hypothetical protein  31.58 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0005  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  40.28 
 
 		 377 aa  54.3  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3455  hypothetical protein  29.3 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2926  hypothetical protein  31.36 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0687011  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3264  hypothetical protein  30.07 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>