17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0724 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0724  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
392 aa  800    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0696  TPR repeat-containing protein  99.23 
 
 
392 aa  797    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3528  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.22 
 
 
389 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5152  peptidoglycan-binding domain 1 protein  58.57 
 
 
358 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5007  hypothetical protein  58.59 
 
 
398 aa  160  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  31.28 
 
 
1094 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.78 
 
 
524 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  32.76 
 
 
958 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.28 
 
 
192 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.15 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.73 
 
 
176 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.01 
 
 
510 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0542  HEAT domain containing protein  26.46 
 
 
250 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.77 
 
 
1343 aa  46.2  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  30.71 
 
 
501 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.5 
 
 
1438 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 
404 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>