25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3192 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3192  YcfA family protein  100 
 
 		 80 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0334864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2276  YcfA family protein  68.35 
 
 		 79 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0979587  hitchhiker  0.00000437635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2213  YcfA family protein  68.35 
 
 		 79 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0355  hypothetical protein  69.62 
 
 		 80 aa  114  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1137  YcfA family protein  54.43 
 
 		 80 aa  92  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0318024  normal  0.63493 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0794  hypothetical protein  47.5 
 
 		 82 aa  90.5  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.331284  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2582  hypothetical protein  39.24 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  47.62 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  47.62 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  44.44 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  42.31 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  49.35 
 
 		 73 aa  51.2  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  44.16 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  44.16 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  44.59 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  41.33 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  38.46 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  47.62 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0399  YcfA-like  38.57 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463825  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4379  YcfA family protein  44.07 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000396987  unclonable  0.0000000014534 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  37.5 
 
 		 76 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3238  YcfA family protein  40.54 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  35.44 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0152  hypothetical protein  35.14 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2649  YcfA-like  39.66 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>