17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1680 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1680  DNA polymerase, beta-like region  100 
 
 		 281 aa  583  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0015  hypothetical protein  50.74 
 
 		 289 aa  311  1e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2811  DNA polymerase beta domain protein region  52.04 
 
 		 289 aa  305  5.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.625389  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1754  DNA polymerase beta subunit  41.15 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0999806  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2474  hypothetical protein  38.55 
 
 		 281 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7419  hypothetical protein  35.71 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1987  DNA polymerase beta domain protein region  39.2 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1402  DNA polymerase beta domain protein region  35.1 
 
 		 275 aa  152  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2971  DNA polymerase beta domain protein region  33.19 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0583646  normal  0.297818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00100  nucleotidyltransferase family protein  28.91 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.994546  normal  0.283746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1978  hypothetical protein  24.35 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1637  hypothetical protein  30 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3528  DNA polymerase beta domain protein region  29.19 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3751  hypothetical protein  26.73 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1674  DNA polymerase, beta-like region  35.85 
 
 		 105 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.538651  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2758  hypothetical protein  50 
 
 		 42 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1506  hypothetical protein  23.42 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00830658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>