164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1203 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1203  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  951    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0491  SpoVR family protein  66.59 
 
 		 462 aa  633  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.488778  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1539  stage V sporulation protein R  62.83 
 
 		 449 aa  567  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1332  stage V sporulation protein R  62.61 
 
 		 449 aa  565  1e-160  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0448775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2507  stage V sporulation-like protein, SpoVR  46.04 
 
 		 478 aa  451  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3004  SpoVR family protein  39.25 
 
 		 459 aa  309  8e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0512  hypothetical protein  37.47 
 
 		 466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1158  SpoVR family protein  37.92 
 
 		 485 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2004  SpoVR family protein  37.82 
 
 		 470 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1395  SpoVR family protein  37.5 
 
 		 473 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0551  SpoVR family protein  37.47 
 
 		 475 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4512  stage V sporulation protein R  37.58 
 
 		 471 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105304 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0822  stage V sporulation protein R  37.06 
 
 		 472 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0646  SpoVR family protein  37.44 
 
 		 470 aa  281  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0680  SpoVR family protein  36.7 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0929  stage V sporulation protein R  37.39 
 
 		 472 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0853  stage V sporulation protein R  36.85 
 
 		 470 aa  277  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258518  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0680  stage V sporulation protein R  37.39 
 
 		 472 aa  277  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0668  stage V sporulation protein R  37.39 
 
 		 472 aa  277  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0857  stage V sporulation protein R  36.85 
 
 		 470 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000642993 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0731  stage V sporulation protein R  37.17 
 
 		 472 aa  274  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0767  stage V sporulation protein R  37.17 
 
 		 472 aa  274  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2539  SpoVR family protein  35.23 
 
 		 495 aa  257  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.624214 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0593  SpoVR family protein  35.45 
 
 		 419 aa  256  6e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2992  SpoVR family protein  31.1 
 
 		 513 aa  253  4.0000000000000004e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1228  hypothetical protein  32.91 
 
 		 499 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2159  SpoVR family protein  34.77 
 
 		 520 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223118  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2731  SpoVR family protein  33.54 
 
 		 499 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.792518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2637  SpoVR family protein  32.91 
 
 		 499 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0820118  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1514  SpoVR family protein  35.12 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1942  SpoVR family protein  35.12 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1946  SpoVR family protein  35.12 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1329  SpoVR family protein  35.12 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000362879  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2002  SpoVR family protein  35.12 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01539  SpoVR family protein  35.57 
 
 		 519 aa  247  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0883  SpoVR family protein  32.45 
 
 		 516 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.800321  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2364  SpoVR family protein  34.13 
 
 		 510 aa  244  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0656278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2048  SpoVR family protein  34.69 
 
 		 502 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0996469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1740  SpoVR family protein  34.69 
 
 		 502 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0137532  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01163  hypothetical protein  34.27 
 
 		 510 aa  243  5e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2460  SpoVR family protein  34.27 
 
 		 510 aa  243  5e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222624  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01173  hypothetical protein  34.27 
 
 		 510 aa  243  5e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000266726  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1675  SpoVR family protein  34.27 
 
 		 510 aa  243  5e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000834062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1291  SpoVR family protein  34.27 
 
 		 510 aa  243  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1333  SpoVR family protein  34.27 
 
 		 510 aa  243  5e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000395748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2437  SpoVR family protein  34.27 
 
 		 510 aa  243  5e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00512702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1961  SpoVR family protein  34.27 
 
 		 510 aa  243  6e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00693869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0625  SpoVR family protein  36.59 
 
 		 416 aa  243  7e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003983  hypothetical protein  34.55 
 
 		 519 aa  242  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1465  SpoVR family protein  33.94 
 
 		 516 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2004  SpoVR family protein  35.04 
 
 		 511 aa  240  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000607664  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1831  SpoVR family protein  32.99 
 
 		 510 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1346  SpoVR family protein  34.05 
 
 		 510 aa  239  8e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00649322  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3555  SpoVR family protein  33.88 
 
 		 517 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1998  SpoVR family protein  33.75 
 
 		 511 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.154757  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1960  SpoVR family protein  34.94 
 
 		 504 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2362  SpoVR family protein  33.75 
 
 		 511 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  0.544957 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2108  SpoVR family protein  33.75 
 
 		 511 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2215  SpoVR family protein  33.54 
 
 		 511 aa  238  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4172  SpoVR family protein  32.02 
 
 		 500 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2747  SpoVR family protein  33.76 
 
 		 511 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00597319  decreased coverage  0.0000564649 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2727  SpoVR family protein  35.19 
 
 		 507 aa  237  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2858  SpoVR family protein  35.19 
 
 		 507 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2206  SpoVR family protein  33 
 
 		 505 aa  236  6e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4653  SpoVR family protein  31.48 
 
 		 499 aa  236  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.283151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1234  SpoVR family protein  33.82 
 
 		 509 aa  236  8e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0453  SpoVR family protein  34.17 
 
 		 423 aa  236  8e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1392  SpoVR family protein  31.67 
 
 		 521 aa  236  9e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4633  SpoVR family protein  32.14 
 
 		 520 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.217683 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3777  SpoVR family protein  32.29 
 
 		 538 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130387 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1949  SpoVR family protein  34.62 
 
 		 513 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0479181  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0545  SpoVR like family protein  31.93 
 
 		 520 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4019  SpoVR family protein  31.79 
 
 		 521 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2329  SpoVR family protein  33.96 
 
 		 542 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851956  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2245  SpoVR family protein  34.62 
 
 		 519 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0368477  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1512  SpoVR family protein  33.26 
 
 		 559 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.854578  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1530  SpoVR family protein  32.99 
 
 		 559 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376164  normal  0.61215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5141  SpoVR family protein  32.14 
 
 		 523 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0731  SpoVR family protein  33.95 
 
 		 515 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1744  SpoVR family protein  33.76 
 
 		 513 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46890  SpoVR family protein  31.33 
 
 		 520 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2255  SpoVR family protein  32.24 
 
 		 576 aa  231  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1591  SpoVR family protein  33.06 
 
 		 559 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.762696  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1135  SpoVR family protein  33.06 
 
 		 507 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1615  SpoVR family protein  33.06 
 
 		 559 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244629  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1623  SpoVR family protein  32.58 
 
 		 557 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2156  SpoVR family protein  33.47 
 
 		 508 aa  230  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0915233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3058  SpoVR family protein  32.64 
 
 		 519 aa  230  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1227  SpoVR family protein  33.54 
 
 		 578 aa  230  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2884  SpoVR family protein  32.93 
 
 		 508 aa  230  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4753  SpoVR family protein  33.06 
 
 		 559 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135349  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2007  SpoVR family protein  32.11 
 
 		 552 aa  229  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1982  SpoVR family protein  33.47 
 
 		 511 aa  229  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1569  SpoVR family protein  31.99 
 
 		 508 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00678887  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1708  SpoVR family protein  32.91 
 
 		 515 aa  229  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0816979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07650  SpoVR family protein  32.5 
 
 		 517 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3487  SpoVR family protein  34.15 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.241137  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1923  SpoVR family protein  33.19 
 
 		 507 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000604699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1636  SpoVR family protein  32.19 
 
 		 508 aa  227  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115572  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0729  SpoVR family protein  32.29 
 
 		 517 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>