More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0325 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  51.54 
 
 		 647 aa  670    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  51.68 
 
 		 647 aa  694    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  51.92 
 
 		 676 aa  666    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  49.55 
 
 		 682 aa  643    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  53.88 
 
 		 652 aa  712    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  100 
 
 		 645 aa  1338    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  51.94 
 
 		 644 aa  669    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  56.62 
 
 		 635 aa  754    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  56.47 
 
 		 635 aa  752    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  62.58 
 
 		 642 aa  852    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  48.21 
 
 		 686 aa  632  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  47.31 
 
 		 692 aa  629  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  47.47 
 
 		 714 aa  630  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  48.06 
 
 		 685 aa  626  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  49.33 
 
 		 716 aa  625  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  46.66 
 
 		 689 aa  618  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  46.45 
 
 		 704 aa  610  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  45.62 
 
 		 691 aa  594  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  45.99 
 
 		 802 aa  585  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  45.01 
 
 		 678 aa  580  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  45.67 
 
 		 687 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  46.94 
 
 		 681 aa  561  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  44.99 
 
 		 683 aa  557  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  45.45 
 
 		 678 aa  558  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  46.33 
 
 		 690 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  45.9 
 
 		 690 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  43.71 
 
 		 680 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  45.88 
 
 		 690 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  44.83 
 
 		 686 aa  535  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  44.25 
 
 		 679 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  43.82 
 
 		 679 aa  534  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  42.84 
 
 		 681 aa  534  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  45.2 
 
 		 699 aa  527  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  44.99 
 
 		 679 aa  519  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  43.28 
 
 		 684 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  41.88 
 
 		 680 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  41.88 
 
 		 680 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  41.88 
 
 		 680 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  42.73 
 
 		 682 aa  509  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  41.34 
 
 		 680 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  41.99 
 
 		 680 aa  504  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  41.64 
 
 		 738 aa  496  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  40.24 
 
 		 650 aa  419  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  36.81 
 
 		 600 aa  362  1e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  48.44 
 
 		 846 aa  318  3e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  30 
 
 		 587 aa  213  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  29.94 
 
 		 573 aa  208  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  28.35 
 
 		 583 aa  206  9e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.5 
 
 		 577 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  28.26 
 
 		 576 aa  196  9e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  28.26 
 
 		 576 aa  196  9e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  28.48 
 
 		 574 aa  193  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.19 
 
 		 566 aa  183  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  28.98 
 
 		 575 aa  183  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.24 
 
 		 566 aa  179  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  26.67 
 
 		 543 aa  177  8e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.55 
 
 		 542 aa  174  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.72 
 
 		 566 aa  173  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  27.39 
 
 		 542 aa  171  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  27.24 
 
 		 562 aa  171  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  24.16 
 
 		 700 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  28.01 
 
 		 552 aa  167  8e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  25.08 
 
 		 543 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1409  NAD synthetase  24.96 
 
 		 561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  26.55 
 
 		 565 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  27.06 
 
 		 545 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  27.06 
 
 		 564 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  26.27 
 
 		 599 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  25.74 
 
 		 658 aa  163  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  29.43 
 
 		 554 aa  162  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  25.87 
 
 		 561 aa  161  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  26.9 
 
 		 567 aa  160  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  27.37 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  25.74 
 
 		 567 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  25.12 
 
 		 560 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.8 
 
 		 577 aa  158  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  24.8 
 
 		 591 aa  157  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  26.47 
 
 		 540 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  26.47 
 
 		 540 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  25.16 
 
 		 571 aa  157  6e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  26.73 
 
 		 567 aa  157  7e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  26.29 
 
 		 540 aa  156  9e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  25.25 
 
 		 558 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  27.47 
 
 		 539 aa  156  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  26.5 
 
 		 567 aa  155  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  25.63 
 
 		 554 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  26.15 
 
 		 577 aa  155  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  25.35 
 
 		 582 aa  154  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  25.55 
 
 		 538 aa  154  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  24.84 
 
 		 561 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  25.63 
 
 		 554 aa  154  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  25.65 
 
 		 547 aa  153  8.999999999999999e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6745  NAD+ synthetase  24.96 
 
 		 688 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.960806 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0307  NAD+ synthetase  26.73 
 
 		 569 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.770204  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  26.27 
 
 		 552 aa  152  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  26.09 
 
 		 540 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  24.69 
 
 		 561 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  27.19 
 
 		 571 aa  152  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  25 
 
 		 591 aa  151  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  25.4 
 
 		 552 aa  151  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>