23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2502 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2502  TM2  100 
 
 		 140 aa  278  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000265771  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5043  hypothetical protein  77.52 
 
 		 184 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307475  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5316  TM2  77.78 
 
 		 144 aa  220  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0480  TM2  79.84 
 
 		 134 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4145  TM2 domain-containing protein  79.07 
 
 		 132 aa  216  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4964  TM2 domain-containing protein  75.76 
 
 		 139 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5141  TM2 domain-containing protein  77.52 
 
 		 139 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0374  TM2 domain-containing protein  76.56 
 
 		 139 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5091  hypothetical protein  75.76 
 
 		 139 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0167  TM2 domain-containing protein  72.18 
 
 		 135 aa  204  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05210  hypothetical protein  74.05 
 
 		 134 aa  202  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0498  hypothetical protein  72.52 
 
 		 134 aa  200  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1993  TM2 domain-containing protein  72.8 
 
 		 135 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0383529  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03100  TM2 domain-containing hypothetical protein  80.3 
 
 		 133 aa  196  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0299  TM2 domain containing protein  69.53 
 
 		 135 aa  191  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000251621  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1622  hypothetical protein  72 
 
 		 132 aa  185  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4937  TM2 domain containing protein  42.42 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2399  TM2 domain-containing protein  52.46 
 
 		 169 aa  62  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324538  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1825  TM2 domain containing protein  40.3 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4957  TM2  46.15 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0479  TM2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  58.82 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2261  TM2 domain-containing protein  40 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46379  normal  0.197019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>