28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2253 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2253  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  606  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2249  hypothetical protein  32.72 
 
 
294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4616  hypothetical protein  28.5 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3747  hypothetical protein  28.5 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3776  hypothetical protein  28.5 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0733274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0007  hypothetical protein  28.19 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00121916  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6439  hypothetical protein  30.36 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.450105 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00501  hypothetical protein  26.13 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00271  hypothetical protein  26.13 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01368  hypothetical protein  26.13 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7608  hypothetical protein  26.34 
 
 
301 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2275  hypothetical protein  28.38 
 
 
295 aa  62.8  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.137375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1772  hypothetical protein  28.65 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.077291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1591  hypothetical protein  28.65 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1616  hypothetical protein  28.65 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0064  hypothetical protein  24.21 
 
 
298 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1846  hypothetical protein  33.75 
 
 
167 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0440208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2205  hypothetical protein  26.14 
 
 
330 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673181  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1194  hypothetical protein  35.94 
 
 
167 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0750788  normal  0.0212804 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1282  hypothetical protein  25.68 
 
 
340 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.313485 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2692  hypothetical protein  25.13 
 
 
338 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1111  hypothetical protein  32.81 
 
 
167 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03897  hypothetical protein  41.27 
 
 
158 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.707951  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2556  hypothetical protein  32.31 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.677539  normal  0.127216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13380  hypothetical protein  30.43 
 
 
175 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420978  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3326  hypothetical protein  41.51 
 
 
349 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.364508 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5732  hypothetical protein  24.44 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52083 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5127  hypothetical protein  24.44 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>