19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6439 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6439  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  664    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.450105 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0007  hypothetical protein  57.74 
 
 
335 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00121916  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1282  hypothetical protein  62.34 
 
 
340 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.313485 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2205  hypothetical protein  28.77 
 
 
330 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.673181  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2692  hypothetical protein  30.98 
 
 
338 aa  93.2  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2253  hypothetical protein  30.36 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.445298  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2249  hypothetical protein  29.12 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01954  hypothetical protein  30.16 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.091836  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4616  hypothetical protein  30.43 
 
 
267 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3747  hypothetical protein  30.43 
 
 
267 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3776  hypothetical protein  30.43 
 
 
267 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0733274 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7608  hypothetical protein  32.75 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00501  hypothetical protein  27.66 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00271  hypothetical protein  27.66 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01368  hypothetical protein  27.66 
 
 
308 aa  54.3  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3326  hypothetical protein  24.86 
 
 
349 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.364508 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1591  hypothetical protein  25 
 
 
291 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1616  hypothetical protein  25 
 
 
291 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1772  hypothetical protein  25 
 
 
291 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.077291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>