22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_R0071 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_R0071  RNA component of RNaseP  100 
 
 		 338 bp  670    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.202054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0007    96.97 
 
 		 344 bp  58  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.877668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0042  RNA component of RNaseP  96.88 
 
 		 301 bp  56  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.293311  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0033  RNA component of RNaseP  94.29 
 
 		 304 bp  54  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256591  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0032  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 333 bp  52  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.148898 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0034  RNA component of RNaseP  94.12 
 
 		 333 bp  52  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0944967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0051  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 290 bp  50.1  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000411974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0007  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 390 bp  50.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.390255  normal  0.448753 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0027  RNA component of RNaseP  96.55 
 
 		 285 bp  50.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0040  RNA component of RNaseP  93.94 
 
 		 360 bp  50.1  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.26217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0035  RNase P RNA  93.94 
 
 		 354 bp  50.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0056  RNaseP RNA  91.89 
 
 		 301 bp  50.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0039  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 353 bp  48.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.835147  hitchhiker  0.000446609 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0029  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 364 bp  48.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.830354  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1398  sRNA  93.75 
 
 		 422 bp  48.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0014  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 308 bp  48.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00479029 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4508  RNase P RNA component precursor RnpB  93.75 
 
 		 396 bp  48.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0037  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 356 bp  48.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0007  RNA component of RNaseP  93.75 
 
 		 373 bp  48.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0034  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 333 bp  46.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0634985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0014  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 342 bp  46.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0052  RNA component of RNaseP  93.55 
 
 		 355 bp  46.1  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>