18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7119 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7119  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6693  hypothetical protein  48.48 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6458  hypothetical protein  48.48 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0252294  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1377  hypothetical protein  45.65 
 
 		 195 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.848105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0837  hypothetical protein  46.71 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3598  hypothetical protein  43.89 
 
 		 186 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2373  hypothetical protein  44.58 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.569946  normal  0.17387 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5864  putative transmembrane protein  43.93 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1451  hypothetical protein  45 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.327616 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6194  hypothetical protein  43.27 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814966  normal  0.751646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4366  hypothetical protein  42.7 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4842  hypothetical protein  43.53 
 
 		 192 aa  104  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1038  integral membrane protein  32.95 
 
 		 196 aa  94.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655647  normal  0.0177657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0985  putative transmembrane protein  53.95 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7129  integral membrane protein  32.59 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00415291  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  39.08 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  28.76 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  28.29 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>