15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1451 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1451  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  360  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.327616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1377  hypothetical protein  70.59 
 
 
195 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.848105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4366  hypothetical protein  78.12 
 
 
192 aa  239  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4842  hypothetical protein  76.04 
 
 
192 aa  230  9e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6194  hypothetical protein  70.98 
 
 
193 aa  222  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814966  normal  0.751646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2373  hypothetical protein  59.14 
 
 
185 aa  201  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.569946  normal  0.17387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3598  hypothetical protein  62.43 
 
 
186 aa  186  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0837  hypothetical protein  57.22 
 
 
210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180181  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6458  hypothetical protein  56 
 
 
191 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0252294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6693  hypothetical protein  56 
 
 
191 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5864  putative transmembrane protein  53.76 
 
 
192 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7119  hypothetical protein  45 
 
 
196 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0985  putative transmembrane protein  67.03 
 
 
102 aa  111  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1038  integral membrane protein  40.83 
 
 
196 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655647  normal  0.0177657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7129  integral membrane protein  35.97 
 
 
193 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00415291  normal  0.23587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>