19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6693 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6458  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0252294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6693  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0837  hypothetical protein  62.96 
 
 
210 aa  225  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180181  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5864  putative transmembrane protein  58.82 
 
 
192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1377  hypothetical protein  60.67 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.848105 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2373  hypothetical protein  57.63 
 
 
185 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.569946  normal  0.17387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3598  hypothetical protein  57.23 
 
 
186 aa  180  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1451  hypothetical protein  56 
 
 
192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.327616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4366  hypothetical protein  57.61 
 
 
192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4842  hypothetical protein  57.07 
 
 
192 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6194  hypothetical protein  58.38 
 
 
193 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814966  normal  0.751646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7119  hypothetical protein  48.48 
 
 
196 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0985  putative transmembrane protein  61.54 
 
 
102 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1038  integral membrane protein  40.12 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655647  normal  0.0177657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7129  integral membrane protein  31.33 
 
 
193 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00415291  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6288  hypothetical protein  40.54 
 
 
99 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6691  hypothetical protein  39.19 
 
 
123 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6456  hypothetical protein  39.19 
 
 
123 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5301  hypothetical protein  34.83 
 
 
186 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>