15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2373 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2373  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  357  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.569946  normal  0.17387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1377  hypothetical protein  65.56 
 
 
195 aa  217  7.999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.848105 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6458  hypothetical protein  57.63 
 
 
191 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0252294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6693  hypothetical protein  57.63 
 
 
191 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0837  hypothetical protein  55.74 
 
 
210 aa  187  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180181  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3598  hypothetical protein  57.3 
 
 
186 aa  182  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1451  hypothetical protein  59.14 
 
 
192 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.327616 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6194  hypothetical protein  64.37 
 
 
193 aa  179  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814966  normal  0.751646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4366  hypothetical protein  61.75 
 
 
192 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4842  hypothetical protein  60.66 
 
 
192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5864  putative transmembrane protein  49.17 
 
 
192 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7119  hypothetical protein  44.58 
 
 
196 aa  118  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0985  putative transmembrane protein  56.52 
 
 
102 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1038  integral membrane protein  39.89 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655647  normal  0.0177657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7129  integral membrane protein  34.69 
 
 
193 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00415291  normal  0.23587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>