15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4842 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4842  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4366  hypothetical protein  95.31 
 
 
192 aa  294  6e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1377  hypothetical protein  72.25 
 
 
195 aa  259  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.848105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1451  hypothetical protein  76.04 
 
 
192 aa  246  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.327616 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6194  hypothetical protein  68.39 
 
 
193 aa  204  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814966  normal  0.751646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2373  hypothetical protein  60.66 
 
 
185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.569946  normal  0.17387 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6458  hypothetical protein  57.07 
 
 
191 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0252294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6693  hypothetical protein  57.07 
 
 
191 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3598  hypothetical protein  62.15 
 
 
186 aa  180  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0837  hypothetical protein  59.89 
 
 
210 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180181  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5864  putative transmembrane protein  55.49 
 
 
192 aa  168  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7119  hypothetical protein  43.53 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0985  putative transmembrane protein  65.96 
 
 
102 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1038  integral membrane protein  37.16 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655647  normal  0.0177657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7129  integral membrane protein  35.33 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00415291  normal  0.23587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>