15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0837 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0837  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  417  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180181  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6458  hypothetical protein  62.96 
 
 
191 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0252294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6693  hypothetical protein  62.96 
 
 
191 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5864  putative transmembrane protein  60.53 
 
 
192 aa  224  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1377  hypothetical protein  63.19 
 
 
195 aa  209  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.848105 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2373  hypothetical protein  57.38 
 
 
185 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.569946  normal  0.17387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3598  hypothetical protein  54.79 
 
 
186 aa  174  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1451  hypothetical protein  57.22 
 
 
192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.327616 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6194  hypothetical protein  59.56 
 
 
193 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814966  normal  0.751646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4366  hypothetical protein  59.32 
 
 
192 aa  161  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4842  hypothetical protein  59.89 
 
 
192 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7119  hypothetical protein  48.15 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0985  putative transmembrane protein  64.13 
 
 
102 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1038  integral membrane protein  40.7 
 
 
196 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.655647  normal  0.0177657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7129  integral membrane protein  36.46 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00415291  normal  0.23587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>