19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7090 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7090  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  249  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296196  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3600  hypothetical protein  52.54 
 
 
119 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265041  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5064  hypothetical protein  52.54 
 
 
119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939937  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1412  hypothetical protein  49.15 
 
 
119 aa  126  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.104355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0363  hypothetical protein  48.36 
 
 
122 aa  121  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07570  hypothetical protein  49.58 
 
 
120 aa  120  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3018  hypothetical protein  41.53 
 
 
123 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0019  hypothetical protein  40.98 
 
 
124 aa  93.6  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.816073  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2880  hypothetical protein  42.97 
 
 
121 aa  85.9  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.476591  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0698  hypothetical protein  43.09 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000671001  normal  0.0854698 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2077  CoA-binding protein  32.2 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1015  CoA-binding domain protein  31.09 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0560  CoA-binding domain protein  28.57 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.89222  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1828  hypothetical protein  24.79 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1548  hypothetical protein  24.79 
 
 
122 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16153  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  32.71 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0989  CoA-binding domain protein  30.25 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2600  CoA-binding domain protein  28.87 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00073882  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0652  CoA-binding domain protein  28.97 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000133994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>