39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6746 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6746  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  899    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0342  hypothetical protein  42.23 
 
 		 419 aa  347  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120057  hitchhiker  0.001602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3008  hypothetical protein  38.98 
 
 		 419 aa  297  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14040  beta-lactamase domain protein  31.3 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0623  beta-lactamase domain protein  20.9 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1254  Beta-lactamase-like  33.64 
 
 		 348 aa  53.1  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.104793  normal  0.017013 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  32.26 
 
 		 461 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  32.26 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  32.26 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.04 
 
 		 778 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1173  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.68 
 
 		 750 aa  51.6  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00434485  hitchhiker  0.000212306 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2351  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 		 318 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000261549  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3468  beta-lactamase domain protein  26.25 
 
 		 283 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000679545  normal  0.805088 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  31.18 
 
 		 461 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  31.18 
 
 		 461 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.26 
 
 		 797 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0492  beta-lactamase-like  20.73 
 
 		 338 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.565585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2499  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.46 
 
 		 783 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304772 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1002  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.3 
 
 		 749 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1713  beta-lactamase domain-containing protein  21.79 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.12 
 
 		 818 aa  47.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4102  beta-lactamase domain protein  31.18 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.6 
 
 		 752 aa  47  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  33.71 
 
 		 651 aa  46.6  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.42 
 
 		 808 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2727  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.92 
 
 		 757 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.44 
 
 		 777 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.97 
 
 		 814 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0044  beta-lactamase-like protein  19.27 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2072  beta-lactamase domain protein  24.82 
 
 		 294 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2283  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  31.87 
 
 		 342 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3578  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 		 281 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.2 
 
 		 798 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.7 
 
 		 811 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1942  beta-lactamase-like  29.25 
 
 		 423 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.57 
 
 		 789 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1135  beta-lactamase domain protein  23.62 
 
 		 320 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000516269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2833  S-layer protein, putative  29.76 
 
 		 136 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00678266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>