More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5291 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1429  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.03 
 
 
2363 aa  925    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1425  KR domain protein  32.75 
 
 
6876 aa  853    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0862  Beta-ketoacyl synthase  39.19 
 
 
5854 aa  1026    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3096  erythronolide synthase  56.28 
 
 
1315 aa  738    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0001  polyketide synthase  35.42 
 
 
4874 aa  915    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  39.4 
 
 
4036 aa  973    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1665  polyketide synthase, putative  41.82 
 
 
4649 aa  970    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1666  polyketide synthase, putative  56.67 
 
 
5566 aa  699    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1673  thiotemplate mechanism natural product synthetase  53.16 
 
 
3925 aa  658    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1674  polyketide synthase  44.96 
 
 
5628 aa  838    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5297  KR domain protein  49.1 
 
 
2727 aa  691    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0222593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5290  erythronolide synthase, 6-methylsalicylic acid synthase  48.88 
 
 
4429 aa  1560    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0863  Beta-ketoacyl synthase  47.92 
 
 
1440 aa  737    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.139933  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1480  putative polyketide synthase PksJ  35.6 
 
 
5023 aa  914    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1395  putative polyketide synthase PksJ  37.95 
 
 
5021 aa  893    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  42.55 
 
 
7157 aa  1113    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  35.41 
 
 
7149 aa  765    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1430  KR domain protein  35.1 
 
 
5612 aa  1050    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5291  erythronolide synthase, Mycocerosate synthase  100 
 
 
4588 aa  9515    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0861  Beta-ketoacyl synthase  43.25 
 
 
3525 aa  765    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0859  Beta-ketoacyl synthase  43.46 
 
 
1601 aa  885    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.782867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3097  beta-ketoacyl synthase  47.73 
 
 
4869 aa  2069    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0167  putative polyketide synthase PksJ  35.74 
 
 
3818 aa  914    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  71.35 
 
 
5802 aa  1109    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0858  Beta-ketoacyl synthase  50.75 
 
 
2725 aa  629  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5289  KR domain protein  43.92 
 
 
1911 aa  623  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1393  polyketide synthase, type I  46.91 
 
 
4555 aa  600  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2618  OnnB  46.56 
 
 
4539 aa  598  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  46.5 
 
 
2653 aa  593  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  43.25 
 
 
4212 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  43.82 
 
 
5822 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  43.59 
 
 
5778 aa  585  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3094  erythronolide synthase  47.06 
 
 
1262 aa  579  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  43.01 
 
 
5915 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  41.69 
 
 
4580 aa  567  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  41.55 
 
 
4123 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  41.6 
 
 
4048 aa  567  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  41.55 
 
 
4157 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  41.69 
 
 
4101 aa  567  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  41.69 
 
 
4098 aa  567  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  41.55 
 
 
4122 aa  567  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  52.87 
 
 
2726 aa  562  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1478  polyketide synthase, type I  52.87 
 
 
4614 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4312  erythronolide synthase  40.41 
 
 
2260 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.908395 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  36.5 
 
 
5993 aa  538  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2597  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  39.44 
 
 
2284 aa  524  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4314  beta-ketoacyl synthase  35.52 
 
 
3231 aa  520  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1423  6-methylsalicylic acid synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  38.85 
 
 
2501 aa  513  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1205  putative polyketide synthase  39.48 
 
 
1749 aa  511  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  28.38 
 
 
3695 aa  498  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5919  beta-ketoacyl synthase  42.59 
 
 
2463 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253672 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2619  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  41.2 
 
 
1619 aa  493  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4313  beta-ketoacyl synthase  44.96 
 
 
2393 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.415713 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2377  Beta-ketoacyl synthase  27.71 
 
 
1613 aa  486  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  40.64 
 
 
3811 aa  484  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5292  erythronolide synthase, Beta-ketoacyl-acyl- carrier-protein synthase I  40.86 
 
 
1696 aa  468  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0888589  normal  0.456588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 
2551 aa  460  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1932a  modular polyketide synthase  43.46 
 
 
591 aa  459  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.527668  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.66 
 
 
1656 aa  442  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  31.23 
 
 
3099 aa  441  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2383  condensation domain protein  32.91 
 
 
2006 aa  437  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0864  amino acid adenylation domain protein  36.15 
 
 
2063 aa  437  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  38.38 
 
 
1939 aa  434  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2887  Beta-ketoacyl synthase  42.52 
 
 
1208 aa  427  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  29.57 
 
 
4478 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  40.57 
 
 
2551 aa  422  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2136  hypothetical protein  29.17 
 
 
3781 aa  422  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  38.55 
 
 
3252 aa  420  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0976  Beta-ketoacyl synthase  37.94 
 
 
1272 aa  416  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.801633  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2111  hypothetical protein  29.41 
 
 
3780 aa  418  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  44.36 
 
 
2232 aa  416  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  39.25 
 
 
2762 aa  417  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1664  polyketide synthase, putative  38.8 
 
 
2082 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685154  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3098  mycocerosate synthase  40.28 
 
 
1717 aa  412  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  29.89 
 
 
3696 aa  406  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  42.75 
 
 
1804 aa  407  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  29.85 
 
 
3130 aa  404  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  38.45 
 
 
3702 aa  404  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1667  polyketide synthase, putative  38.45 
 
 
1901 aa  404  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  38.39 
 
 
3693 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  40.5 
 
 
1909 aa  403  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  38.39 
 
 
3693 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  41.95 
 
 
1144 aa  400  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  41.06 
 
 
1087 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  38.39 
 
 
3676 aa  402  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  41.39 
 
 
1587 aa  392  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  40.15 
 
 
2462 aa  395  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.74 
 
 
1354 aa  395  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  42.94 
 
 
1337 aa  394  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  37.97 
 
 
2880 aa  390  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  38.95 
 
 
2103 aa  392  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  35.87 
 
 
3930 aa  387  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  37.62 
 
 
3679 aa  385  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  37.88 
 
 
2333 aa  387  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0171  polyketide synthase  34.99 
 
 
1798 aa  388  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0449  DszB  34.99 
 
 
1778 aa  388  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  40.93 
 
 
1582 aa  385  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  39.81 
 
 
1000 aa  384  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  40.98 
 
 
1424 aa  380  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2385  Beta-ketoacyl synthase  36.77 
 
 
1298 aa  382  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0539638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>