16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4640 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4640  hypothetical protein  100 
 
 		 1322 aa  2739    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.963654  normal  0.0174413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3186  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1079 aa  169  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.187937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3006  YD repeat protein  27.99 
 
 		 1263 aa  149  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4387  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1056 aa  121  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95296  hitchhiker  0.00457818 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1097  YD repeat protein  22.91 
 
 		 1229 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.791752  unclonable  0.0000000000274764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4144  YD repeat protein  25.87 
 
 		 1092 aa  109  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  0.283099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2667  YD repeat-containing protein  23.87 
 
 		 1152 aa  102  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3730  YD repeat-containing protein  23.87 
 
 		 1152 aa  102  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0100146  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1049  YD repeat protein  24.31 
 
 		 1084 aa  97.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2075  YD repeat protein  24.27 
 
 		 1129 aa  90.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1394  YD repeat protein  37.5 
 
 		 1129 aa  82.8  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2121  YD repeat protein  34.58 
 
 		 1837 aa  70.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0873035  normal  0.943874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3209  hypothetical protein  37.35 
 
 		 2395 aa  52  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304767  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7100  YD repeat protein  35.44 
 
 		 1065 aa  49.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  38.14 
 
 		 2252 aa  48.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1521  hypothetical protein  31.37 
 
 		 1807 aa  45.8  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442861  normal  0.0305188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>