13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0899 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0899  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  324  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0900  hypothetical protein  31.94 
 
 		 159 aa  84.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6618  hypothetical protein  32.72 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3520  hypothetical protein  27.78 
 
 		 172 aa  70.5  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4472  hypothetical protein  35.56 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1970  hypothetical protein  31.09 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0162497  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0511  hypothetical protein  45.59 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.194479  normal  0.142642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1665  hypothetical protein  25.18 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1908  hypothetical protein  37.5 
 
 		 277 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  31.58 
 
 		 274 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2945  hypothetical protein  27.54 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  34.67 
 
 		 276 aa  49.7  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  36.11 
 
 		 264 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>