23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_R0062 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_R0062  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000546753  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0003  tRNA-Leu  88.33 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  91.49 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00479422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0024  tRNA-Leu  87.84 
 
 		 88 bp  60  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0043  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 87 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0222956  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0041  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  85.96 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0020  tRNA-Leu  84.93 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26000  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0026  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0562961  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  90 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0022  tRNA-Leu  83.33 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0005  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1372  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0031  tRNA-Leu  83.78 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0019  tRNA-Leu  87.23 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000107083  hitchhiker  3.09031e-20 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0046  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna20  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0079  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0051  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00133482  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0044  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0708961  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1633  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.372837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>