163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3331 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3331  hypothetical protein  100 
 
 
662 aa  1335    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0524  protein of unknown function DUF214  43.18 
 
 
676 aa  537  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.245064  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0837  peptide ABC transporter permease  33.68 
 
 
655 aa  355  2e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.696049  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1307  peptide ABC transporter permease  33.87 
 
 
666 aa  348  3e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0658  ABC transporter, permease protein  33.85 
 
 
681 aa  334  3e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0975  ABC transporter, permease protein, putative  32.35 
 
 
651 aa  323  5e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1790  hypothetical protein  30.02 
 
 
641 aa  311  2e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111831  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1912  peptide ABC transporter permease  31.86 
 
 
669 aa  296  9e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1090  protein of unknown function DUF214  32.17 
 
 
657 aa  287  5.999999999999999e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4556  ABC transporter, permease  28.85 
 
 
634 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4949  ABC transporter permease protein  27.8 
 
 
634 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4963  ABC transporter, permease  28.23 
 
 
634 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4984  ABC transporter, permease protein  27.13 
 
 
649 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4670  hypothetical protein  27.21 
 
 
649 aa  229  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4722  ABC transporter permease  27.22 
 
 
649 aa  219  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5084  ABC transporter permease  27.22 
 
 
649 aa  219  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.265996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4955  efflux ABC transporter, permease protein  27.59 
 
 
649 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4945  efflux ABC transporter, permease protein  27.22 
 
 
649 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4580  ABC transporter, permease  27.27 
 
 
649 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2203  ABC transporter, permease protein  28.44 
 
 
670 aa  214  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4564  ABC transporter, permease  26.64 
 
 
649 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.206962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4971  efflux ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 
649 aa  212  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0280  ABC transporter, permease component  26.42 
 
 
649 aa  211  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5202  ABC transporter, permease component  27.67 
 
 
641 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1525  hypothetical protein  27.2 
 
 
622 aa  203  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4554  ABC transporter, permease protein  26.06 
 
 
640 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760166  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2645  hypothetical protein  24.63 
 
 
666 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2701  hypothetical protein  24.63 
 
 
666 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0714  hypothetical protein  25.79 
 
 
640 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4170  ABC transporter, permease  26.19 
 
 
640 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.256087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4333  ABC transporter permease  26.19 
 
 
640 aa  183  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.403638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4668  ABC transporter permease  26.19 
 
 
640 aa  183  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0699  ABC transporter, permease  25.93 
 
 
640 aa  183  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4516  ABC transporter, permease protein  26.04 
 
 
640 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0680  ABC transporter permease protein  25.77 
 
 
640 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00920993  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4527  ABC transporter, permease protein  25.92 
 
 
640 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4569  ABC transporter, permease protein  26.06 
 
 
640 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1811  ABC transporter, permease  25.49 
 
 
626 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.178931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2076  permease domain-containing protein  25.15 
 
 
626 aa  179  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00474198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4181  ABC transporter, permease  25.89 
 
 
640 aa  178  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2576  efflux ABC transporter, permease protein  27.05 
 
 
644 aa  177  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1862  hypothetical protein  24.81 
 
 
626 aa  177  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3308  hypothetical protein  24.66 
 
 
626 aa  177  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.694511  hitchhiker  0.0000199726 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1827  ABC transporter permease  25.34 
 
 
626 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0776042  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2174  protein of unknown function DUF214  25.43 
 
 
635 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4282  hypothetical protein  25.6 
 
 
640 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.855208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2096  hypothetical protein  24.92 
 
 
626 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000483001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2033  hypothetical protein  25.71 
 
 
626 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98953e-36 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3151  hypothetical protein  26.63 
 
 
640 aa  170  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4332  ABC transporter permease  27.49 
 
 
638 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491332  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4667  ABC transporter permease  27.49 
 
 
638 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2001  hypothetical protein  25.12 
 
 
597 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0306259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4180  ABC transporter, permease  27.01 
 
 
638 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4553  ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 
637 aa  167  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.388232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2621  efflux ABC transporter, permease protein  25.5 
 
 
643 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080038 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4169  ABC transporter, permease  27.51 
 
 
637 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2350  ABC transporter, permease  25.5 
 
 
643 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0681  ABC transporter, permease protein  26.42 
 
 
636 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.003357  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2530  hypothetical protein  25.71 
 
 
643 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00952012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4515  ABC transporter, permease protein  27.33 
 
 
638 aa  165  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.834594 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4679  hypothetical protein  24.09 
 
 
656 aa  163  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2747  efflux ABC transporter, permease protein  25.51 
 
 
643 aa  160  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.543337  hitchhiker  0.00000301265 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4526  ABC transporter, permease protein  26.62 
 
 
637 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3150  hypothetical protein  26.32 
 
 
637 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2325  hypothetical protein  23.62 
 
 
645 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.93865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2384  ABC transporter, permease  24.22 
 
 
641 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0584897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0120  permease domain-containing protein  23.25 
 
 
659 aa  151  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4568  ABC transporter, permease protein  26.36 
 
 
637 aa  150  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0270  hypothetical protein  23.84 
 
 
659 aa  150  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3485  hypothetical protein  22.27 
 
 
656 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4281  hypothetical protein  25.57 
 
 
637 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4590  ABC transporter, permease  22.48 
 
 
651 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2660  efflux ABC transporter, permease protein  26.56 
 
 
643 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000354246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0267  ABC transporter, permease component  22.37 
 
 
657 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1511  hypothetical protein  23.11 
 
 
626 aa  145  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0723575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4680  hypothetical protein  22.93 
 
 
652 aa  145  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2622  permease domain-containing protein  26.25 
 
 
643 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0226022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4569  ABC transporter, permease  23.41 
 
 
657 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00654206  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4994  permease domain-containing protein  22.16 
 
 
657 aa  144  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0119  putative ABC transporter, permease protein  22.63 
 
 
675 aa  144  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.086048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4589  ABC transporter, permease  23.95 
 
 
657 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4950  hypothetical protein  23.81 
 
 
657 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5250  ABC transporter; permease  24.08 
 
 
617 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4964  putative permease  22.63 
 
 
651 aa  140  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2725  hypothetical protein  23.24 
 
 
626 aa  138  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2782  hypothetical protein  23.24 
 
 
626 aa  138  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4730  permease  21.8 
 
 
651 aa  138  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5090  permease  21.8 
 
 
651 aa  138  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4992  permease, putative  23.07 
 
 
651 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4570  ABC transporter, permease  21.41 
 
 
651 aa  137  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0344591  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  21.75 
 
 
702 aa  136  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.863248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4979  putative permease  22.67 
 
 
651 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1856  ABC transporter permease  26.01 
 
 
412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0269  putative permease  21.47 
 
 
651 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4797  ABC transporter; permease  23.3 
 
 
617 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4966  hypothetical protein  21.73 
 
 
658 aa  135  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2307  hypothetical protein  23.74 
 
 
656 aa  134  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00102704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4662  hypothetical protein  23.95 
 
 
620 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4981  hypothetical protein  21.25 
 
 
658 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0288  ABC transporter, permease  24.67 
 
 
620 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>