78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3216 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2173  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 228 aa  325  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3176  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 228 aa  325  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00365869  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3216  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 158 aa  322  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1507  transposase  42.86 
 
 		 242 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2608  hypothetical protein  42.86 
 
 		 223 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0847  transposase  41.03 
 
 		 228 aa  99.8  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0442  hypothetical protein  37.42 
 
 		 199 aa  95.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1358  hypothetical protein  37.42 
 
 		 199 aa  95.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0840  transposase  39.74 
 
 		 228 aa  94.7  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0547  transposase  39.74 
 
 		 228 aa  94.7  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0111  transposase  39.74 
 
 		 228 aa  94.7  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0610  hypothetical protein  40.8 
 
 		 134 aa  87.4  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1069  hypothetical protein  35.03 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000554936  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1655  hypothetical protein  40.2 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4090  hypothetical protein  46.27 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6765  transposase IS3/IS911 family protein  36.7 
 
 		 103 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2165  ISBma4, transposase  30.34 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2249  ISBma4, transposase  30.34 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2532  ISBma4, transposase  30.34 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.409059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3042  ISBma4, transposase  30.34 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  29.36 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  29.36 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  29.36 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  29.36 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  29.36 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  29.36 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  29.36 
 
 		 121 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  29.36 
 
 		 121 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  29.36 
 
 		 121 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  29.36 
 
 		 121 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  29.36 
 
 		 121 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  29.36 
 
 		 121 aa  44.3  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  29.36 
 
 		 121 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  29.36 
 
 		 121 aa  44.3  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  29.36 
 
 		 121 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  29.36 
 
 		 121 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  29.36 
 
 		 121 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  29.36 
 
 		 121 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  29.36 
 
 		 121 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  29.36 
 
 		 121 aa  43.9  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  29.79 
 
 		 335 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1684  transposase IS3/IS911  31.87 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  31.52 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2063  transposase IS3/IS911  30.3 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0960401 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0903  transposase IS3/IS911  30.3 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0648  transposase IS3/IS911  30.3 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185599 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0389  transposase IS3/IS911  30.3 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.995377  normal  0.39936 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0294  transposase IS3/IS911  30.3 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00451426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  31.52 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  31.52 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  29.79 
 
 		 335 aa  43.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1193  transposase IS3/IS911 family protein  30.21 
 
 		 98 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.062228  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2510  transposase IS3/IS911  26.76 
 
 		 104 aa  42  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.728215  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2074  transposase IS3/IS911  26.76 
 
 		 104 aa  42  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1119  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  28.72 
 
 		 335 aa  41.2  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3190  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1074  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1728  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1929  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2005  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00032179  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2009  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0899439  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2650  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.737543  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2659  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.041855  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3064  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4308  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477471  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0655  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0131  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4461  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4450  transposase IS3/IS911 family protein  35.23 
 
 		 96 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.967947  normal  0.727343 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  32.2 
 
 		 325 aa  41.2  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  32.2 
 
 		 309 aa  41.2  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1148  transposase IS3/IS911 family protein  34 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2965  transposase IS3/IS911 family protein  34 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173924  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1050  transposase IS3/IS911  35.23 
 
 		 96 aa  40.8  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  28.57 
 
 		 133 aa  40.8  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0424  transposase IS3/IS911  35.23 
 
 		 96 aa  40.8  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3020  transposase IS3/IS911  35.23 
 
 		 96 aa  40.8  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>