41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0814 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0814  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  293  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0466862  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0724  hypothetical protein  79.22 
 
 
156 aa  192  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.47932  normal  0.627224 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1829  hypothetical protein  62.25 
 
 
156 aa  155  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0926  hypothetical protein  62.25 
 
 
159 aa  153  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1771  hypothetical protein  61.74 
 
 
166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0589  hypothetical protein  55.1 
 
 
151 aa  134  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1117  hypothetical protein  51.02 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1560  hypothetical protein  37.33 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1238  hypothetical protein  38.21 
 
 
160 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3294  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1835  hypothetical protein  35.51 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03832  hypothetical protein  37.59 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0547406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0709  hypothetical protein  32.37 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16043e-28 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3141  hypothetical protein  30.28 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.820618  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3242  hypothetical protein  30.28 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613004  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1953  hypothetical protein  31.62 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0698  hypothetical protein  31.65 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0315317  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0250  hypothetical protein  31.06 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.846895  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1659  hypothetical protein  34.56 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3060  hypothetical protein  29.29 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1535  hypothetical protein  31.11 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1641  hypothetical protein  31.06 
 
 
158 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000251884  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2378  hypothetical protein  32.56 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3043  hypothetical protein  30.28 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173126  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1833  hypothetical protein  32.64 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00164737  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13471  HAMP domain-containing protein  38.84 
 
 
132 aa  58.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3523  hypothetical protein  28.26 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1798  hypothetical protein  28.46 
 
 
160 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.425473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0865  hypothetical protein  25.56 
 
 
151 aa  51.2  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.580747  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1413  hypothetical protein  27.89 
 
 
160 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000339871 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0643  hypothetical protein  28.79 
 
 
151 aa  50.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792914  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4545  hypothetical protein  27.89 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5116  hypothetical protein  29.63 
 
 
144 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.965316  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4689  hypothetical protein  27.89 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.679753 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4176  hypothetical protein  27.89 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0709  hypothetical protein  27.88 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2484  hypothetical protein  31.58 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0932997  normal  0.113715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2648  hypothetical protein  28.18 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0922458  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2956  hypothetical protein  29.17 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1026  hypothetical protein  40.48 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4884  hypothetical protein  27.94 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.319335 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0286  hypothetical protein  26.36 
 
 
154 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>