48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1189 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1189  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  597  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0801  protein of unknown function DUF125 transmembrane  77.66 
 
 
291 aa  487  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1272  hypothetical protein  71.13 
 
 
291 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1572  protein of unknown function DUF125 transmembrane  73.7 
 
 
291 aa  457  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.493606  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1070  hypothetical protein  71.43 
 
 
292 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0912  protein of unknown function DUF125 transmembrane  63.92 
 
 
291 aa  399  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1196  protein of unknown function DUF125 transmembrane  64.64 
 
 
285 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1514  hypothetical protein  50.72 
 
 
292 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0438  hypothetical protein  48.94 
 
 
284 aa  278  8e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0423  hypothetical protein  48.94 
 
 
284 aa  278  8e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0215  protein of unknown function DUF125 transmembrane  47 
 
 
300 aa  271  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1809  hypothetical protein  46.76 
 
 
288 aa  264  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.305818  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1685  protein of unknown function DUF125 transmembrane  48.91 
 
 
289 aa  263  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1173  protein of unknown function DUF125 transmembrane  46.83 
 
 
293 aa  263  2e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01890  uncharacterized membrane protein  48.12 
 
 
297 aa  260  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0860  hypothetical protein  47.35 
 
 
293 aa  260  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.110107  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1653  hypothetical protein  46.1 
 
 
291 aa  260  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.850435  normal  0.0303841 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1049  hypothetical protein  45.16 
 
 
293 aa  239  5e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2800  protein of unknown function DUF125 transmembrane  44.37 
 
 
292 aa  226  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.792813  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0331  hypothetical protein  36.96 
 
 
287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.464299  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0496  hypothetical protein  34.39 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1758  hypothetical protein  34.04 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0216697  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0704  hypothetical protein  33.69 
 
 
299 aa  144  1e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.258152  normal  0.502019 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0774  hypothetical protein  34.04 
 
 
297 aa  144  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.443952 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1650  hypothetical protein  30.71 
 
 
290 aa  120  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.381623  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1094  hypothetical protein  35.18 
 
 
374 aa  97.1  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0835  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.27 
 
 
358 aa  95.5  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0379  hypothetical protein  23.03 
 
 
362 aa  82.8  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0378  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.4 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0516728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1468  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.05 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181021  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  26.63 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.1 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  25.52 
 
 
376 aa  67  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  27.69 
 
 
365 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0522  hypothetical protein  22.36 
 
 
319 aa  59.3  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.655797  normal  0.060241 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  25.65 
 
 
387 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.63 
 
 
401 aa  53.1  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.171497  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  24.61 
 
 
396 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1689  hypothetical protein  26.04 
 
 
383 aa  52.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0161  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.6 
 
 
399 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279325  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3216  protein of unknown function DUF125 transmembrane  25.68 
 
 
389 aa  49.3  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000032928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1784  Rubrerythrin  27.68 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1505  rubrerythrin  27.68 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276735  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.35 
 
 
234 aa  42.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  33.82 
 
 
231 aa  42.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  33.82 
 
 
231 aa  42.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  35.82 
 
 
227 aa  42.4  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  33.82 
 
 
231 aa  42.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>