60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_R0022 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_R0022  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0035  tRNA-Cys  94.83 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0036  tRNA-Cys  94.83 
 
 		 71 bp  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.793802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0049  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 71 bp  87.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0020  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.219554  normal  0.362228 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0017  tRNA-Cys  93.1 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t26  tRNA-Cys  93.1 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.286394  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07687  tRNA-Cys  90.62 
 
 		 71 bp  79.8  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0035  tRNA-Cys  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.497187  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0034  tRNA-Cys  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0030  tRNA-Cys  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.581991  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0032  tRNA-Cys  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.352047  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tCys01  tRNA-Cys  95.35 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00920591  normal  0.0362691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0014  tRNA-Cys  95.65 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000913003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0080  tRNA-Cys  88.71 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249942  hitchhiker  0.00446925 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0079  tRNA-Cys  88.71 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342909  hitchhiker  0.0044915 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0056  tRNA-Cys  95.65 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000403241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0037  tRNA-Cys  95.65 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0016  tRNA-Cys  97.14 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.348827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0538  tRNA-Cys  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.435960000000001e-32 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0459686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0613  tRNA-Cys  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000112744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5719  tRNA-Cys  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00287559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4764  tRNA-Cys  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  92.68 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000664876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0650273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0128228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5684  tRNA-Cys  92.68 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0257731  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0003  tRNA-Cys  97.3 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.785195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0091  tRNA-Cys  92.68 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0115005  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0040  tRNA-Cys  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.578047  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0069  tRNA-Cys  92.68 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0040  tRNA-Cys  92.68 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0026  tRNA-Cys  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0034  tRNA-Cys  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528755  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0087  tRNA-Cys  90.24 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500213  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0037  tRNA-Cys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0117844 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2454  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0051  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0027  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2153  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.332579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2769  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1864  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0059  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0104  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.916479  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0065  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000051222  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0013  tRNA-Cys  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201212  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0015  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000242975  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0026  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000374248  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0042  tRNA-Cys  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0037  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0093  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139562  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0027  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0070  tRNA-Cys  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00415694  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0026  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0004  tRNA-Cys  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.120043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0038  tRNA-Cys  90.48 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0024  tRNA-Cys  85.19 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500819  normal  0.307833 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  90.48 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000388055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>