10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_R0004 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_R0004  tRNA-Cys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.120043  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0042  tRNA-Cys  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.220787  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1223  tRNA-Cys  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0426798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0056  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000403241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0037  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0014  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000913003  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0036  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.793802 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0035  tRNA-Cys  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0022  tRNA-Cys  100 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>