37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1853 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1853  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  334  2.9999999999999997e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00805  hypothetical protein  58.82 
 
 		 172 aa  182  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.277049  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4922  hypothetical protein  54.55 
 
 		 180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5956  hypothetical protein  35.29 
 
 		 191 aa  97.1  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0211287  normal  0.0139937 
 
 
-
 
NC_002950  PG0336  hypothetical protein  36.3 
 
 		 189 aa  89.4  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.625981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0853  hypothetical protein  29.55 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0265193 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1544  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  23.75 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.170767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2884  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  28.79 
 
 		 521 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3702  hypothetical protein  24.82 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4396  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  24.82 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2989  plasmid pRiA4b ORF-3-like  25.18 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176424  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0736  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  23.31 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2027  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  24.09 
 
 		 522 aa  47.8  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000415443  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0009  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.1 
 
 		 472 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1222  hypothetical protein  22.67 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3209  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  22.54 
 
 		 236 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3347  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  22.54 
 
 		 236 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0224  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.01 
 
 		 482 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1868  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.01 
 
 		 482 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3014  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.01 
 
 		 482 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3229  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  33.01 
 
 		 482 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0186  hypothetical protein  22.67 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1826  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.21 
 
 		 233 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4772  hypothetical protein  24.81 
 
 		 645 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021908 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2928  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  22.95 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1895  hypothetical protein  23.97 
 
 		 198 aa  42  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1556  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  25 
 
 		 181 aa  42  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.568333 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6856  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  26.09 
 
 		 198 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424573  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7311  hypothetical protein  25.76 
 
 		 219 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4094  hypothetical protein  23.48 
 
 		 180 aa  41.2  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7710  hypothetical protein  25.76 
 
 		 219 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7408  hypothetical protein  25.76 
 
 		 219 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3332  hypothetical protein  25.76 
 
 		 219 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0270  hypothetical protein  25.76 
 
 		 219 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1473  hypothetical protein  25.76 
 
 		 224 aa  41.2  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0966536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1350  hypothetical protein  26.03 
 
 		 188 aa  40.8  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0718153  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4574  hypothetical protein  29.9 
 
 		 417 aa  40.8  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.284031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>