13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4574 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4574  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  857    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.284031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4772  hypothetical protein  24.64 
 
 		 645 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2944  hypothetical protein  30.43 
 
 		 333 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2506  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.89 
 
 		 130 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0566  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.08 
 
 		 130 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3209  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  28.23 
 
 		 236 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3347  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  28.23 
 
 		 236 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4524  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  28.81 
 
 		 192 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2884  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.56 
 
 		 521 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0186  hypothetical protein  28.91 
 
 		 200 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1222  hypothetical protein  28.91 
 
 		 200 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2272  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  22.82 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2027  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.52 
 
 		 522 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000415443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>