More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1231 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1231  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 280 aa  560  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6503  Integral membrane protein TerC  53.09 
 
 		 271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  48.3 
 
 		 248 aa  238  9e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  47.88 
 
 		 250 aa  226  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  48.67 
 
 		 248 aa  226  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  47.35 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  47.45 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  46.18 
 
 		 253 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  43.06 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1725  Integral membrane protein TerC  49.07 
 
 		 268 aa  215  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  46.54 
 
 		 238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  46.72 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  47.79 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  45.77 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  47.41 
 
 		 238 aa  208  9e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  44.92 
 
 		 239 aa  208  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  48.29 
 
 		 245 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  48.08 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  48.63 
 
 		 243 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  45.59 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  46.13 
 
 		 264 aa  206  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  45.32 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  48.45 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  46.33 
 
 		 250 aa  206  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  45.95 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2953  Integral membrane protein TerC  45.32 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000321183  unclonable  0.0000000329078 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  45.65 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  48.26 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  42.7 
 
 		 518 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  45.29 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  44.35 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  42.49 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  46.67 
 
 		 246 aa  200  3e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  43.8 
 
 		 522 aa  199  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  44.57 
 
 		 253 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  48.41 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  48.41 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  45.6 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  48.41 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  48.41 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  48.41 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  45.2 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  45.2 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  45.2 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  42.14 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  40.88 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  44.8 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  44.32 
 
 		 247 aa  195  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  43.56 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  43.75 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1627  Integral membrane protein TerC  43.12 
 
 		 256 aa  195  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.189416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0242  integral membrane protein TerC  44.66 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0423547  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  48.02 
 
 		 237 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  48.02 
 
 		 237 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000383082  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  48.02 
 
 		 237 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  48.02 
 
 		 237 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  48.02 
 
 		 237 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000421681  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  48.02 
 
 		 237 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  48.02 
 
 		 237 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  48.02 
 
 		 237 aa  195  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000012685  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  48.02 
 
 		 237 aa  195  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130968  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  45.88 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3379  integral membrane protein TerC  44.03 
 
 		 530 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  44.7 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  45.21 
 
 		 251 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  46.12 
 
 		 238 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  45.15 
 
 		 245 aa  193  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  44.14 
 
 		 514 aa  192  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  46.33 
 
 		 251 aa  192  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  45.02 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  40.46 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  45.62 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  43.61 
 
 		 244 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  41.57 
 
 		 523 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  41.41 
 
 		 519 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  41.41 
 
 		 519 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  41.96 
 
 		 518 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  41.41 
 
 		 519 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  41.41 
 
 		 519 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  41.41 
 
 		 519 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  41.25 
 
 		 241 aa  188  7e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  41.18 
 
 		 523 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  41.18 
 
 		 523 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  41.18 
 
 		 523 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  44.49 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  40.64 
 
 		 518 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  42.37 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  42.37 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5520  integral membrane protein TerC  43.12 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350667  normal  0.0618236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  45.35 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  42.63 
 
 		 510 aa  186  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  40.23 
 
 		 518 aa  185  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  40.23 
 
 		 518 aa  185  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  40.23 
 
 		 518 aa  185  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  40.23 
 
 		 518 aa  185  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  40.23 
 
 		 518 aa  185  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  40.23 
 
 		 518 aa  185  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  40.23 
 
 		 518 aa  185  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  40.23 
 
 		 518 aa  185  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  44.88 
 
 		 249 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>