34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0111 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0111  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  478  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.485373  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1404  hypothetical protein  53.3 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.472507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4253  hypothetical protein  44.68 
 
 		 232 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4144  putative permease  44.26 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.4015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4194  putative permease  44.26 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4088  putative permease  44.26 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6583  hypothetical protein  42.37 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.286525 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4073  hypothetical protein  44.07 
 
 		 232 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.811034  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04050  vacuole protein, putative  32.1 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701829  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0489  hypothetical protein  34.45 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3403  protein of unknown function UPF0005  42.06 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1927  hypothetical protein  28.88 
 
 		 222 aa  53.9  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199344  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28110  hypothetical protein  35.21 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1630  hypothetical protein  34.32 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.068558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3164  hypothetical protein  35.88 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.30239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3333  hypothetical protein  35.88 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.722624  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1842  hypothetical protein  34.35 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3596  hypothetical protein  34.35 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3990  hypothetical protein  34.35 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0132572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2487  hypothetical protein  35.11 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234713  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3246  hypothetical protein  27.78 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000289843  hitchhiker  0.0000576794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3395  hypothetical protein  33.59 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.912483  normal  0.775889 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84906  predicted protein  25.31 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.521244  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1506  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0005 domain protein)  24.49 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.874501  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0466  protein of unknown function UPF0005  28.45 
 
 		 221 aa  45.4  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2604  hypothetical protein  32.52 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1784  hypothetical protein  27.13 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30410  hypothetical protein  32.52 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01133  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74710]  25.2 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.234786  normal  0.0831451 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3472  hypothetical protein  27.11 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.31473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2451  hypothetical protein  34.48 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000005036  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1726  hypothetical protein  37.21 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.327418 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1518  hypothetical protein  29.88 
 
 		 233 aa  42  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.884646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0852  hypothetical protein  25.73 
 
 		 230 aa  42  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000920073  hitchhiker  0.0000816273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>