126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2351 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2351  protein of unknown function DUF156  100 
 
 
76 aa  152  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0184  hypothetical protein  81.58 
 
 
91 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0240  protein of unknown function DUF156  67.11 
 
 
76 aa  114  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0277  protein of unknown function DUF156  68.42 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00351414  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2002  hypothetical protein  69.33 
 
 
77 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2725  protein of unknown function DUF156  67.11 
 
 
76 aa  108  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0121  hypothetical protein  64.86 
 
 
86 aa  102  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1624  protein of unknown function DUF156  35.62 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00315628  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2026  hypothetical protein  35.44 
 
 
88 aa  53.5  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3585  protein of unknown function DUF156  40.62 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000231569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0676  hypothetical protein  34.62 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0115732  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1674  hypothetical protein  40.35 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.184479  hitchhiker  0.000845863 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1838  protein of unknown function DUF156  36.49 
 
 
91 aa  50.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0351  nickel resistance determinant  31.94 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000183122  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1421  hypothetical protein  36.62 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0973225  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0737  hypothetical protein  37.5 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140648  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0685  hypothetical protein  37.5 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0671  hypothetical protein  37.5 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0154231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0775  hypothetical protein  37.5 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A01  hypothetical protein  39.22 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0821974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0936  hypothetical protein  37.5 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000387132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0829  hypothetical protein  37.5 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00649804  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0869  hypothetical protein  37.5 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000891846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0865  hypothetical protein  37.5 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2303  protein of unknown function DUF156  38.6 
 
 
87 aa  48.9  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4106  hypothetical protein  33.78 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0298431  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4507  YrkD  37.5 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000126278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0101  protein of unknown function DUF156  41.38 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0685  hypothetical protein  37.5 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3295  hypothetical protein  32.43 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484311  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0617  hypothetical protein  35.21 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0538  hypothetical protein  35.21 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0774012  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0819  hypothetical protein  40.35 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405513  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0741  protein of unknown function DUF156  36.21 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000244551  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3027  hypothetical protein  28.21 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.120862 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1210  protein of unknown function DUF156  37.5 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21310  hypothetical protein  30.65 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.643143  hitchhiker  0.00553883 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  38.98 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2141  hypothetical protein  31.17 
 
 
110 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.52001  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  38.98 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1293  protein of unknown function DUF156  31.51 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1694  hypothetical protein  36.54 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.607073  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2514  hypothetical protein  29.03 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.193584  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0270  hypothetical protein  31.75 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0036  hypothetical protein  29.03 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0036  hypothetical protein  29.03 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2433  hypothetical protein  28.12 
 
 
86 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4322  hypothetical protein  28.57 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1741  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0132  hypothetical protein  36.84 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2187  hypothetical protein  30.14 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1898  hypothetical protein  30.14 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0461  hypothetical protein  26.92 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000042131  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0543  hypothetical protein  33.33 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5753  hypothetical protein  31.75 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286958  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2124  hypothetical protein  36.54 
 
 
97 aa  42.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0114083  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2162  hypothetical protein  36.54 
 
 
97 aa  42.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2404  hypothetical protein  35.59 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000296567  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3360  hypothetical protein  30.51 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552779  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0533  hypothetical protein  30.49 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0395944  normal  0.0381301 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  29.82 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2574  protein of unknown function DUF156  32.31 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000536206  hitchhiker  0.00036449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  34.55 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3757  hypothetical protein  32 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0445  hypothetical protein  30.49 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.467567  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01250  hypothetical protein  31.17 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  35.59 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4587  hypothetical protein  36.21 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1136  protein of unknown function DUF156  30.67 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0362  protein of unknown function DUF156  29.63 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1069  protein of unknown function DUF156  32.39 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000553897  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5648  protein of unknown function DUF156  36.21 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3465  protein of unknown function DUF156  30.67 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0950133  normal  0.633622 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3691  hypothetical protein  29.09 
 
 
135 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.32018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  33.9 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3257  protein of unknown function DUF156  39.68 
 
 
96 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4045  hypothetical protein  34.38 
 
 
93 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3516  hypothetical protein  32.73 
 
 
122 aa  41.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1650  hypothetical protein  35.09 
 
 
93 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0387  protein of unknown function DUF156  29.49 
 
 
102 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.837751  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0725  protein of unknown function DUF156  26.56 
 
 
86 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.66886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3876  hypothetical protein  31.17 
 
 
103 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000226345  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4130  protein of unknown function DUF156  25 
 
 
127 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3435  hypothetical protein  37.04 
 
 
91 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2676  hypothetical protein  33.93 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0141  hypothetical protein  29.03 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  32.88 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0484  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.082192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2635  protein of unknown function DUF156  34.48 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.459536  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2039  protein of unknown function DUF156  30.65 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00245608  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4549  protein of unknown function DUF156  32.81 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1739  protein of unknown function DUF156  35.59 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0478748  hitchhiker  0.00498764 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2884  hypothetical protein  33.93 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.4932  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2921  hypothetical protein  32.14 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.719524  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0175  hypothetical protein  35.19 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860909  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  36.21 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  36.21 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0072  hypothetical protein  27.27 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0074  hypothetical protein  27.27 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>