62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0305 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  100 
 
 		 246 aa  504  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  68.6 
 
 		 241 aa  358  4e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  35.97 
 
 		 504 aa  184  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  40 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  37.82 
 
 		 494 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0615  hypothetical protein  29.79 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0709  hypothetical protein  28.51 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  29.72 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  28.82 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  29.57 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  28.63 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  27.19 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2596  dolichyl-phosphate mannose synthase  26.99 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  28.57 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4096  hypothetical protein  28.57 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541182 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  26.01 
 
 		 246 aa  72  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  25.68 
 
 		 529 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  23.68 
 
 		 548 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0665457 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2750  hypothetical protein  23.04 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0106  hypothetical protein  26.09 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105806 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0729  Nucleotidyl transferase  25.23 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2610  hypothetical protein  26.15 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  23.85 
 
 		 251 aa  62  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  24.37 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  25.12 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  24.88 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  21.63 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  22.42 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  24.56 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  22.33 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  22.12 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.19 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  25.22 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  24.06 
 
 		 325 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1959  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  22.75 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0146821  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  21.68 
 
 		 331 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3187  Glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  23.5 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00709898  hitchhiker  0.0000413631 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2751  hypothetical protein  21.1 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.01 
 
 		 325 aa  52.8  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  21.76 
 
 		 325 aa  52.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.47 
 
 		 349 aa  52.4  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  25.79 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  23.08 
 
 		 338 aa  51.2  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0020  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.69 
 
 		 333 aa  49.7  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.583446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2465  hypothetical protein  25.27 
 
 		 232 aa  48.9  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  22.01 
 
 		 325 aa  48.9  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  26.97 
 
 		 411 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1800  capsular polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.6322  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1250  nucleotidyl transferase  21.16 
 
 		 257 aa  45.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.396561  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0569  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  35.21 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.706557  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  29.02 
 
 		 411 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  24.47 
 
 		 326 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  27.17 
 
 		 330 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1604  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.01 
 
 		 493 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.610155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0091  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25.85 
 
 		 453 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  23.66 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  27.22 
 
 		 411 aa  42.7  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  25.14 
 
 		 411 aa  43.1  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3694  glucose-1-phosphate cytidylyl-transferase  21.35 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1908  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  23.38 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  24.55 
 
 		 351 aa  42  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>