22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2778 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2778  flp pilus assembly protein FlpE  100 
 
 
229 aa  409  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  hitchhiker  0.0000109666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0323  flp pilus assembly protein FlpE  43.44 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264858  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33370  hypothetical protein  41.94 
 
 
309 aa  94  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.066941  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0618  hypothetical protein  40.39 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  34.08 
 
 
353 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  34.08 
 
 
353 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  34.63 
 
 
365 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  34.2 
 
 
359 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2225  hypothetical protein  40.4 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  34.08 
 
 
353 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  34.29 
 
 
369 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  34.38 
 
 
364 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  32.34 
 
 
403 aa  55.8  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  34.95 
 
 
350 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  36.89 
 
 
346 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25310  hypothetical protein  40.91 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  32.48 
 
 
365 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  33.19 
 
 
352 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0371  type II secretion system protein Z  36.21 
 
 
405 aa  45.4  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.10044  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  31.64 
 
 
355 aa  42.7  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0119  hypothetical protein  28.03 
 
 
391 aa  42.4  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3162  hypothetical protein  37.5 
 
 
362 aa  42  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0841875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>