78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1321 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1321  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  100 
 
 		 100 aa  207  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.091111  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1056  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  69.79 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2741  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  63.73 
 
 		 113 aa  130  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1723  hypothetical protein  67.82 
 
 		 95 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.111522 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25090  hypothetical protein  60.22 
 
 		 97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.516244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1490  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  58.76 
 
 		 100 aa  124  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3766  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  64.71 
 
 		 99 aa  123  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4296  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  62.24 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0987  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  61.11 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318494  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1871  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  62.5 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00237151  normal  0.122981 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1691  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  63.64 
 
 		 96 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0763706  hitchhiker  0.00000452136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2349  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  59.18 
 
 		 100 aa  116  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.259769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3875  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  62.35 
 
 		 97 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1098  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  58.89 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.990683  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3853  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  63.95 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237678  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3839  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  63.95 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0548749  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3927  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  63.95 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11363  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  58.59 
 
 		 101 aa  114  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136994  normal  0.22339 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20090  hypothetical protein  66.67 
 
 		 107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0822875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1005  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  57.65 
 
 		 99 aa  112  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0883  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  63.41 
 
 		 99 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0934  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  69.44 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.415979  normal  0.558967 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08330  hypothetical protein  59.09 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2372  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  60.92 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0864  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  54.35 
 
 		 119 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1960  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  57.65 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1353  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  59.34 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1287  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  63.89 
 
 		 109 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10700  hypothetical protein  61.84 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0815191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5656  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  50 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29230  hypothetical protein  62.5 
 
 		 94 aa  103  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.387512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1694  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  52.81 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00249593  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2585  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  45.92 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000204448  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2317  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  44.33 
 
 		 120 aa  100  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000248141 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0194  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  48.89 
 
 		 96 aa  96.7  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2796  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.33 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.366764  normal  0.0194317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1380  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  35.62 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2394  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.75 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.864742  normal  0.0826838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1250  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  33.85 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.122108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0222  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.34 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4009  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.5 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.102583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1824  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.5 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.507725  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3614  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.5 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0166775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3413  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  32.5 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.098649 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2368  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.03 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1839  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  30.95 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2426  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.82 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109934  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2268  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.55 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1686  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.4 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1012  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.21 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.743684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0946  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.21 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0416889  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1062  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.21 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.88139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1043  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.21 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0979  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.21 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.611574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3591  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  31.25 
 
 		 127 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2607  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.89 
 
 		 106 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0985  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.21 
 
 		 106 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174222  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2761  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.21 
 
 		 106 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000515979  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3184  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.96 
 
 		 120 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.145303 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2715  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.21 
 
 		 106 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28280  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  27.5 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2279  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.21 
 
 		 106 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00245616  normal  0.0342658 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00886  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.21 
 
 		 106 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528097  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2448  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.21 
 
 		 106 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0173302  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1042  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.21 
 
 		 106 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000549481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2693  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.89 
 
 		 106 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0954  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.21 
 
 		 106 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00274651  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3135  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  25.84 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174383  normal  0.142786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00892  hypothetical protein  29.21 
 
 		 106 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.524478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1600  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.89 
 
 		 106 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2055  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.03 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0284539  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30210  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.23 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3354  hypothetical protein  27.96 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.042088  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2586  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  29.23 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.196057  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1263  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  26.19 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.692203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3811  ATP-dependent Clp protease adaptor  32.95 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0299236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1251  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  39.06 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1398  ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS  28.09 
 
 		 106 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.071981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>