22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0122 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0122  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 116 aa  226  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0085  anti-sigma-factor antagonist  45.98 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01250  anti-anti-sigma factor  42.86 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15210  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  38.55 
 
 		 111 aa  67  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0298  anti-sigma-factor antagonist  40.91 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.224332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0557  anti-sigma-factor antagonist  36.63 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2050  anti-sigma-factor antagonist  38.64 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.780099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4854  anti-sigma-factor antagonist  33.73 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4123  anti-sigma-factor antagonist  38.38 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3639  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3141  anti-sigma-factor antagonist  47.27 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.129085  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4150  anti-sigma-factor antagonist  40.91 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2967  anti-sigma-factor antagonist  43.64 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.216635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3203  anti-sigma-factor antagonist  35.64 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6178  anti-sigma-factor antagonist  37.65 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4532  anti-sigma-factor antagonist  28.75 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339774  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3398  anti-sigma-factor antagonist  28.89 
 
 		 115 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.09799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35230  STAS domain-containing protein  45.28 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  24.49 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5292  anti-sigma-factor antagonist  28.09 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.11598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11180  anti-anti-sigma factor  38.64 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0792336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>