28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08440 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_08440  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  951    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.696595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1305  hypothetical protein  54.41 
 
 		 454 aa  526  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.364108  normal  0.63665 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09860  hypothetical protein  52.3 
 
 		 453 aa  508  9.999999999999999e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726307  normal  0.031392 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08410  hypothetical protein  28.83 
 
 		 444 aa  200  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2616  hypothetical protein  26.04 
 
 		 465 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920339  normal  0.35815 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1801  hypothetical protein  25.07 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0111  protein of unknown function DUF407  24.79 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500585  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4830  hypothetical protein  23.91 
 
 		 453 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2154  hypothetical protein  22.55 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  hitchhiker  0.00287082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1453  hypothetical protein  21.96 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3651  hypothetical protein  28.02 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3032  hypothetical protein  28.34 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31543e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1781  hypothetical protein  25.3 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.44232 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4990  hypothetical protein  21.37 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2728  hypothetical protein  26.2 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283161  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0717  hypothetical protein  25.48 
 
 		 429 aa  50.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2702  hypothetical protein  26.11 
 
 		 583 aa  47.4  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2485  hypothetical protein  26.14 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2308  hypothetical protein  26.78 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4238  hypothetical protein  23.48 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0716997 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1756  hypothetical protein  30.67 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2668  hypothetical protein  25.7 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.519412  decreased coverage  0.0000451664 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1195  hypothetical protein  30.67 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.276342  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0792  hypothetical protein  30.67 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.40428  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2400  hypothetical protein  30.67 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286069  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4493  hypothetical protein  24.8 
 
 		 557 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0673  hypothetical protein  30.67 
 
 		 381 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1117  hypothetical protein  30.06 
 
 		 477 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>