45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2301 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2301  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  177  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.962162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0837  hypothetical protein  44 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00554204  hitchhiker  0.000686175 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0753  hypothetical protein  43.21 
 
 		 79 aa  74.3  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000530744 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0431  hypothetical protein  46.34 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0093  hypothetical protein  44.3 
 
 		 80 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0425  hypothetical protein  38.27 
 
 		 81 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4049  hypothetical protein  31.25 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3462  hypothetical protein  42.31 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00193289  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0319  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  40 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1314  hypothetical protein  40.79 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000587692  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1372  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  40.28 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273592  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01810  NADH dehydrogenase I subunit G  29.41 
 
 		 666 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000616939  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1319  hydrogenase large subunit  37.29 
 
 		 645 aa  48.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1367  hydrogenase large subunit  37.29 
 
 		 645 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  34.48 
 
 		 624 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4166  NADH dehydrogenase (quinone)  31.71 
 
 		 530 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02080  hypothetical protein  33.78 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0086  hypothetical protein  37.1 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  29.11 
 
 		 575 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0560  hydrogenase, Fe-only  27.5 
 
 		 666 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00291892  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0495  NADH:ubiquinone oxidoreductase 24 kD subunit-like protein  31.08 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0342  NADH dehydrogenase I, E subunit  27.63 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.702916  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1295  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  28 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0490  hydrogenase large subunit  27.78 
 
 		 653 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1832  hypothetical protein  31.03 
 
 		 82 aa  42.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0324574  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  33.96 
 
 		 569 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  33.85 
 
 		 626 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3351  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  27.63 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.044773 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  32.47 
 
 		 677 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  33.85 
 
 		 626 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4240  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  26.32 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2805  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.82 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.327427 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2098  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  32.31 
 
 		 186 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.380739  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  29.63 
 
 		 570 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3922  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.34 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4006  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  31.34 
 
 		 168 aa  41.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.7952e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1449  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 24 kDa subunit  30.3 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292032  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0728  [Fe] hydrogenase, HymA subunit, putative  30.95 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0781  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 24 kDa subunit  25.97 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0863  hydrogenase subunit HymA, putative  25.97 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_766  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit F subfamily  26.32 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0108  hypothetical protein  29.23 
 
 		 377 aa  40.4  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.996331  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0864  hydrogenase subunit HymB, putative  33.96 
 
 		 640 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_634  [Fe] hydrogenase, HymA subunit  30.95 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0782  NADH dehydrogenase (quinone)  32.08 
 
 		 640 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>