24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2157 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2157  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  521  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2158  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.6 
 
 
266 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.82128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1443  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.57 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1721  hypothetical protein  30.09 
 
 
263 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1779  ABC transporter, permease protein, putative  29.65 
 
 
263 aa  99.8  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0190  hypothetical protein  24.81 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0354  hypothetical protein  24.33 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0455  hypothetical protein  26.24 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3299  ABC transporter, permease  21.94 
 
 
268 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3350  ABC transporter, permease  21.58 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.97912e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3603  ABC transporter, permease protein  21.58 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6354299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4578  putative ABC transporter, permease component  27.11 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000593867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3701  ABC transporter, permease protein  21.58 
 
 
268 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000237165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1616  ABC transporter, permease protein  21.58 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000619745  hitchhiker  0.000000421446 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3609  ABC transporter, permease protein  22.31 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000116329  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0456  hypothetical protein  26.61 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0021  CesD  19.4 
 
 
268 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3278  ABC transporter, permease component  21.22 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00162462  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.76 
 
 
244 aa  52.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1185  hypothetical protein  24.91 
 
 
268 aa  52.8  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1243  hypothetical protein  22.7 
 
 
285 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7393  hypothetical protein  21.64 
 
 
266 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1244  hypothetical protein  21.28 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4528  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  38 
 
 
322 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>