14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1109 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1109  protein of unknown function DUF1646  100 
 
 		 351 aa  678    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2048  protein of unknown function DUF1646  52.38 
 
 		 341 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000531503  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2278  cation transporter-like protein  52.65 
 
 		 359 aa  333  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0903  cation transporter  48.79 
 
 		 370 aa  310  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0905  hypothetical protein  47.45 
 
 		 369 aa  308  9e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0904  cation transporter  48.53 
 
 		 369 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.58881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0665  hypothetical protein  44 
 
 		 380 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00659859  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1303  putative cation transporter  46.55 
 
 		 350 aa  278  8e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0124  hypothetical protein  46.88 
 
 		 372 aa  256  4e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.272093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0604  hypothetical protein  42.39 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000679514  hitchhiker  0.0000000100986 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0848  hypothetical protein  38.32 
 
 		 351 aa  152  7e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11518  normal  0.339338 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1334  hypothetical protein  39.19 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1409  hypothetical protein  34.03 
 
 		 381 aa  115  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.417974 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1876  hypothetical protein  33.73 
 
 		 351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0430501  normal  0.425301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>