More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0394 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0523  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  70.62 
 
 
498 aa  749    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0931485 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2665  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.2 
 
 
504 aa  706    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06740  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.81 
 
 
506 aa  704    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.725577  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0394  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
500 aa  1033    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3214  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.09 
 
 
503 aa  779    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000978494  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0407  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.01 
 
 
506 aa  746    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0111575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.29 
 
 
497 aa  768    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000239611  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01810  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.22 
 
 
505 aa  712    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139734 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0834  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.74 
 
 
507 aa  683    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00885026  hitchhiker  0.000156856 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.35 
 
 
488 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.54 
 
 
485 aa  276  8e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.34 
 
 
483 aa  274  3e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.29 
 
 
482 aa  269  7e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.29 
 
 
482 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.95 
 
 
508 aa  269  8.999999999999999e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.62 
 
 
504 aa  269  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.89 
 
 
503 aa  268  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.95 
 
 
487 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.74 
 
 
487 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.54 
 
 
487 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1429  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.38 
 
 
487 aa  263  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0657932  normal  0.0240553 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.66 
 
 
486 aa  263  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1556  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.45 
 
 
486 aa  263  4e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.35 
 
 
497 aa  263  6e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  35.6 
 
 
484 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.68 
 
 
504 aa  262  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  35.13 
 
 
490 aa  262  1e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.36 
 
 
483 aa  262  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1886  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.75 
 
 
485 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1049  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.76 
 
 
496 aa  260  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  34.93 
 
 
490 aa  260  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1433  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.95 
 
 
496 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1488  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.73 
 
 
497 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04240  IMP dehydrogenase, putative  36.83 
 
 
544 aa  259  6e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0375303  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.73 
 
 
493 aa  259  6e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08496  putative inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.99 
 
 
490 aa  259  7e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1137  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.85 
 
 
488 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3293  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.25 
 
 
488 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1559  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.64 
 
 
490 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.5 
 
 
486 aa  258  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.43 
 
 
498 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.86 
 
 
488 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2984  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.86 
 
 
488 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.17 
 
 
487 aa  257  3e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3142  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.86 
 
 
488 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.88 
 
 
486 aa  257  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.98 
 
 
490 aa  256  5e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.11 
 
 
485 aa  256  8e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.29 
 
 
485 aa  256  8e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2646  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.99 
 
 
488 aa  256  8e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3287  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.57 
 
 
484 aa  256  8e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000039579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.74 
 
 
488 aa  256  9e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1856  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.54 
 
 
487 aa  256  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.03 
 
 
491 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2431  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.88 
 
 
486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.171445 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2056  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.88 
 
 
486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.46 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281369  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1305  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.79 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1235  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.79 
 
 
488 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.916768  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.97 
 
 
494 aa  254  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1360  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.81 
 
 
490 aa  254  3e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0613  IMP dehydrogenase  33.88 
 
 
486 aa  254  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000830235  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.69 
 
 
507 aa  254  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.2 
 
 
486 aa  254  3e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1005  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.81 
 
 
490 aa  254  3e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1234  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.79 
 
 
488 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1370  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.97 
 
 
487 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.810739  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.97 
 
 
487 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24376  normal  0.894393 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3287  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.88 
 
 
486 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00821787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2457  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.88 
 
 
486 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195801  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1524  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.88 
 
 
486 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.048391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2549  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.88 
 
 
486 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.425317  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.88 
 
 
486 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.637626  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1295  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.88 
 
 
486 aa  253  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2405  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.88 
 
 
486 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323419  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0948  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.45 
 
 
486 aa  253  8.000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.69 
 
 
491 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1269  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.99 
 
 
488 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000336634  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.11 
 
 
489 aa  252  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1706  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.47 
 
 
486 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.26 
 
 
487 aa  252  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1461  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.13 
 
 
487 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1313  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.23 
 
 
490 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.905009  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1893  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.47 
 
 
486 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0489208  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0781  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.23 
 
 
489 aa  251  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6086  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.26 
 
 
486 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2024  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.47 
 
 
486 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1991  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.26 
 
 
486 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.08 
 
 
490 aa  250  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2217  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.31 
 
 
490 aa  250  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0764  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.03 
 
 
489 aa  249  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.88 
 
 
485 aa  249  6e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.09 
 
 
496 aa  249  7e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.5 
 
 
482 aa  249  7e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5301  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.26 
 
 
486 aa  249  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.446018  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.42 
 
 
556 aa  249  9e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.33 
 
 
488 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.05 
 
 
487 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.05 
 
 
487 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1160  IMP dehydrogenase  32.73 
 
 
493 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>